(A-1) Articles published in journals indexed by SCI or SCI Expanded, SSCI, AHCI
1-) Kerem Kahraman, Scott A. Robson, Oktay Göcenler, Cansu M. Yenici, Cansu D. Tozkoparan Ceylan, Jennifer M. Klein, Volker Dötsch, Emine Sonay Elgin, Arthur L. Haas, Joshua J. Ziarek, Çağdaş Dağ, 2024. Characterizing the Monomer-Dimer Equilibrium of UbcH8/Ube2L6: A Combined SAXS and NMR Study. ACS Omega
2-) Onat-taşdelen Kadriye Aslıhan, Öztürkel-kabakaş Hatice, Yüksektepe Ecem, Çatav Şükrü Serter, Güzel Gülnur, Çöl Bekir, Kim Hakbeom, Chae Young Kee, Elgin Emine Sonay, 2024. Functional groups matter: metabolomics analysis of Escherichia coli exposed to trans-cinnamic acid and its derivatives unveils common and unique targets. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY
3-) Okan Avcı, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Elgin Emine Sonay, Anık Ülkü, 2023. Development of a hihgly boron tolerant Pseudomonas sp.--Fe-MOF bioanode. ChemistrySelect
4-) Elgin Emine Sonay, Çatav Şükrü Serter, Babayeva Anara, Kim Hakbeom, Dibek Esra, Çöl Bekir, Chae Young Kee, Kıvrak İbrahim, 2023. NMR metabolomics analysis of Escherichia coli cells treated with Turkish propolis water extract reveals nucleic acid metabolism as the major target. JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY
5-) Çatav Şükrü Serter, Elgin Emine Sonay, Dağ Çağdaş, Stark Jaıme L, Küçükakyüz Köksal, 2018. NMR-based metabolomics reveals that plant-derived smoke stimulates root growth via affecting carbohydrate and energy metabolism in maize. Metabolomics
6-) Saraç, N., Uğur, A., Boran, R., Elgin, E.S., 2015. The use of boron compounds for stabilization of lipase from Psedomonas Aaeruginosa ES3 for the detergent industry. Journal of surfactants and detergents
7-) Elgin, E.S., Sökmen, N., Peterson, F.C., Volkman, B.F., Dağ, Ç., Haas, A.L., 2012. E2-binding surface on Uba3 beta-grasp domain undergoes a conformational transition. Proteins- Structure function and bioinformatics
8-) Tuinstra, R.L., Peterson, F.C., Kutlesa, S., Elgin, E.S., Kron, M., Volkman, B.F., 2008. Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state. Proceedings of National Academy of Sciences, USA
9-) Tuinstra, R.L., Peterson, F.C., Elgin, E.S., Pelzek, A., Volkman, B.F., 2007. An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity. Biochemistry
10-) Peterson, F.C., Elgin, E.S., Nelson, T., Zhang, F., Hoeger, T., Linhardt, R., Volkman, B.F., 2004. Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin. The Journal of Biological Chemistry
11-) Kuloğlu, E.S., Mccaslin, D.R., Markley, J.L., Volkman, B.F., 2002. Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions. The Journal of Biological Chemistry
12-) Kuloğlu, E.S., Mccaslin, D.R., Kitabwalla, M., Pauza, C.D., Markley, J.L., Volkman, B.F., 2001. Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin. Biochemistry
13-) Choe, S., Dzakula, Z., Kuloğlu, E.S., Markley, J.L., 1998. Assignment of 1H, 13C, and 15N signals of turkey ovomucoid third domain at pH 2.0. Journal of Biomolecular NMR
(A-4)
1-) Chae Young Kee, Kim Hakbeom, Elgin Emine Sonay, 2024. Discrimination of Turkish Propolis from Different Geographical Origins by NMR Spectroscopy. JOURNAL OF THE KOREAN MAGNETIC RESONANCE SOCIETY
(B-1) Papers verbally presented or published in scientific and art meetings like international conferences, symposiums, panels, and workshops
1-) Babayeva Anara, Elgin Emine Sonay, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, 2021. Investigation of antimicrobial effects of the extracts obtained from propolis samples collected from Rize and Artvin regions in Turkey. Karabağ II. International Congress of Applied Sciences, Azerbaijan, 8-10 November, 2021.
2-) Dibek Esra, Babayeva Anara, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Elgin Emine Sonay, 2021. In vitro studies on the antimicrobial effect of propolis samples collected from some regions in Turkey. International Cappadocia Scientific Research Congress
3-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Elgin Emine Sonay, 2021. Investigation of antimicrobial effect of some phenolic compounds on Escherichia coli.. International Cappadocia Scientific Research Congress
(B-2)
1-) Tepeli Yudum, Ören Tuğba, Çekiç Edip Güvenç, Elgin Emine Sonay, Anık Ülkü, 2017. Development of Hemoglobin Based Electrochemical Glucose Platform. EastWest Chemistry Congress
2-) Elgin Es, Dağ Ç, Sökmen N, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2012. NMR studies of grasp domains from HsUba3 and HsUbe1L indicate conformational flexibility in E2 binding sites. FP7 EAST-NMR Project, Turkish NMR Meeting
3-) Elgin Es, Dağ Ç, Sökmen N, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2012. NMR studies of beta grasp domains from HsUba3 and HsUbe1L indicate conformational flexibility in E2 binding sites. FEBS Special Meeting Protein Quality Control and Ubiquitin Systems in Health and Disease
4-) Kuloğlu Es, Markley Jl, Mccaslin Df, Pauza Cd, Peterson Fc, Volkman Bf, 2002. Lymphotactin a C chemokine that exist in two conformational states under near physiological conditions identification of the heparin binding site. XXth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
(B-3)
1-) Chae Young Kee, Elgin Emine Sonay, 2024. Unveiling the Fingerprint: Regional Variations in Turkish Propolis Composition Using NMR Spectroscopy. ICMRBS 2024- The 30th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
2-) Elgin Emine Sonay, Çatav Şükrü Serter, Babayeva Anara, Kim Hakbeom, Çöl Bekir, Chae Young Kee, 2021. NMR-based metabolomics analysis of Escherichia coli cells exposed to water extract of Turkish propolis. Metabolomics 2021
3-) Vargün Elif, Elgin Emine Sonay, Açık Cihan, 2017. Investigation of antibacterial activity of silver nanoparticles-loaded poly(N-butyl acrylate-block-N-isopropylacrylamide) nanocomposite films. Advanced Polymers viaMacromolecular Engineering
4-) Vargün Elif, Açık Cihan, Elgin Emine Sonay, 2016. Synthesis charecterization and antibacterial activity of reduced graphene oxide poly n butylacrylate block n vinylpyrrolidone nanocomposite films. Macro 2016 World Polymer Congress
5-) Dağ Ç, Elgin Es, Ziarek Jj, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2012. Resonance assignments and secondary structure determination of ISG15 Activating Enzyme UBE1L UF Domain and characterization of its E2 binding site. FP7 EAST-NMR Project, Turkish NMR Meeting
6-) Dağ Ç, Elgin Es, Ziarek Jj, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2012. Characterization of E2 binding surface of ISG15 enzyme Ube1L grasp domain by NMR. FEBS Special Meeting Protein Quality Control and Ubiquitin Systems in Health and Disease
7-) Uğur Aysel, Boran Rukiye, Saraç Nurdan, Elgin Emine Sonay, 2012. Charecterization and stabilization with boron compounds of alkaline lipase from Pseudomonas Aeruginosa ES3 and its potential application as a laundry detergent additive. Protein Engineering for Biocatalysis
8-) Elgin Es, Sökmen N, Dağ Ç, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2011. E2 binding surface on Uba3 beta grasp domain undergoes a conformational transition in the free form. 35th Steenbock Symposium-Advances in Biomolecular NMR
9-) Kuloğlu Es, Kitabwalla M, Markley Jl, Pauza Cd, Volkman Bf, 2000. Solution structure of the human chemokine lymphotactin. XIXth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
10-) Volkman Bf, Wilkens Sj, Lytle B, Westler Wm, Kuloğlu Es, Markley Jl, 2000. Portable affordable protein structure characterization. 41st Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
11-) Kuloğlu Es, Markley Jl, Volkman Bf, 2000. Measurement of restricted diffusion in aligned media. 41st Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
12-) Kuloğlu Es, Assadiporter Fm, Westler Wm, Markley Jl, 1998. The effect of reactive site P1 mutants of ovomucoid third domain from turkey on the pKa value of His57 of chymotrypsin in complex. XVIIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
13-) Kuloğlu Es, Assadi-porter Fm, Westler Wm, Markley Jl, 1998. Reactive site mutants of a kazal inhibitor and their effects on the pKa value of histidine57 of chymotrypsin. 42nd Annual Meeting of Biophysical Society
(B-5)
1-) Dağ Ç, Elgin Es, Ziarek Jj, Volkman Bf, Peterson Fc, Haas Al, 2012. ISG15 aktive edici E1 enzimi Ube1L UF domaininin NMR solüsyon yapısının belirlenmesi. 26. Ulusal Kimya Kongresi
(B-6)
1-) Demir Gül, Dağ Çağdaş, Elgin Emine Sonay, 2012. İnsan RIG 1 Cards domainlerinin ve bu domainlerin ubiquitilasyonunda rol oynayan çeşitli E3 enzimlerinin yapısal çalışmalar için üretilmesi. 26. Ulusal Kimya Kongresi
2-) Dağ Çağdaş, Elgin Emine Sonay, 2009. Rekombinant insan ubiquitin aktive edici E1 enzimi beta grasp domaininin Uba1 bGD Ni sepharose kolonu üzerinde katlanması. Kromatografi 2009
3-) Sökmen Nazlı, Elgin Emine Sonay, 2007. Ubiquitin aktive edici E1 enzimlerinin ubiquitin benzeri domainlerinin saflaştırılması ve izotopik olarak işaretlenmesi. 3. Ulusal Afinite Teknikleri Kongresi
(D-10) Hakemlikler
1-) Medicinal Chemistry. 2019. Hakemlik Sayısı: 1
2-) Biochemistry. 2017. Hakemlik Sayısı: 1
3-) Journal of Proteome Research (ACS). 2015. Hakemlik Sayısı: 1
(D-6) Editörlükler
1-) Editörlük Türü: Dergi. 2022. Mugla Journal of Science and Technology.
(E-1)
1-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 4
2-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 2
3-) The use of boron compounds for stabilization of lipase from Psedomonas Aaeruginosa ES3 for the detergent industry - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 2
4-) NMR metabolomics analysis of Escherichia coli cells treated with Turkish propolis water extract reveals nucleic acid metabolism as the major target - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 1
5-) Functional groups matter: metabolomics analysis of Escherichia coli exposed to trans-cinnamic acid and its derivatives unveils common and unique targets - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 1
6-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 14
7-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
8-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
9-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
10-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
11-) NMR-based metabolomics reveals that plant-derived smoke stimulates root growth via affecting carbohydrate and energy metabolism in maize - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 7
12-) The use of boron compounds for stabilization of lipase from Psedomonas Aaeruginosa ES3 for the detergent industry - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
13-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 6
14-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 4
15-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 2
16-) The use of boron compounds for stabilization of lipase from Psedomonas Aaeruginosa ES3 for the detergent industry - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
17-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 2
18-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 5
19-) NMR-based metabolomics reveals that plant-derived smoke stimulates root growth via affecting carbohydrate and energy metabolism in maize - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
20-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 18
21-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 2
22-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 5
23-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 3
24-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 4
25-) The use of boron compounds for stabilization of lipase from Psedomonas Aaeruginosa ES3 for the detergent industry - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 3
26-) NMR-based metabolomics reveals that plant-derived smoke stimulates root growth via affecting carbohydrate and energy metabolism in maize - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 2
27-) NMR-based metabolomics reveals that plant-derived smoke stimulates root growth via affecting carbohydrate and energy metabolism in maize - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
28-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 5
29-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 5
30-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 16
31-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 5
32-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 2
33-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 4
34-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 2
35-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 2
36-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 3
37-) NMR-based metabolomics reveals that plant-derived smoke stimulates root growth via affecting carbohydrate and energy metabolism in maize - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 2
38-) E2-binding surface on Uba3 beta-grasp domain undergoes a conformational transition - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 1
39-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 10
40-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2018 Atıf Sayısı: 15
41-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2018 Atıf Sayısı: 2
42-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2018 Atıf Sayısı: 2
43-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2018 Atıf Sayısı: 3
44-) The use of boron compounds for stabilization of lipase from Psedomonas Aaeruginosa ES3 for the detergent industry - Atıf Yılı: 2018 Atıf Sayısı: 2
45-) E2-binding surface on Uba3 beta-grasp domain undergoes a conformational transition - Atıf Yılı: 2018 Atıf Sayısı: 2
46-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2017 Atıf Sayısı: 1
47-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2017 Atıf Sayısı: 3
48-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2017 Atıf Sayısı: 2
49-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2017 Atıf Sayısı: 4
50-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2017 Atıf Sayısı: 11
51-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2016 Atıf Sayısı: 13
52-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2016 Atıf Sayısı: 5
53-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2016 Atıf Sayısı: 2
54-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2016 Atıf Sayısı: 3
55-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2016 Atıf Sayısı: 3
56-) The use of boron compounds for stabilization of lipase from Psedomonas Aaeruginosa ES3 for the detergent industry - Atıf Yılı: 2016 Atıf Sayısı: 1
57-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2015 Atıf Sayısı: 6
58-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2015 Atıf Sayısı: 5
59-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2015 Atıf Sayısı: 4
60-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2015 Atıf Sayısı: 3
61-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2015 Atıf Sayısı: 16
62-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2014 Atıf Sayısı: 15
63-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2014 Atıf Sayısı: 4
64-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2014 Atıf Sayısı: 2
65-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2014 Atıf Sayısı: 3
66-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2014 Atıf Sayısı: 3
67-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2013 Atıf Sayısı: 3
68-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2013 Atıf Sayısı: 2
69-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2013 Atıf Sayısı: 1
70-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2013 Atıf Sayısı: 12
71-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2012 Atıf Sayısı: 21
72-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2012 Atıf Sayısı: 1
73-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2012 Atıf Sayısı: 3
74-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2012 Atıf Sayısı: 7
75-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2012 Atıf Sayısı: 2
76-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2011 Atıf Sayısı: 2
77-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2011 Atıf Sayısı: 3
78-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2011 Atıf Sayısı: 4
79-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2011 Atıf Sayısı: 4
80-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2011 Atıf Sayısı: 12
81-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2010 Atıf Sayısı: 15
82-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2010 Atıf Sayısı: 1
83-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2010 Atıf Sayısı: 4
84-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2010 Atıf Sayısı: 3
85-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2010 Atıf Sayısı: 1
86-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2009 Atıf Sayısı: 2
87-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2009 Atıf Sayısı: 3
88-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2009 Atıf Sayısı: 2
89-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2009 Atıf Sayısı: 1
90-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2009 Atıf Sayısı: 19
91-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2008 Atıf Sayısı: 2
92-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2008 Atıf Sayısı: 1
93-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2008 Atıf Sayısı: 1
94-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2008 Atıf Sayısı: 1
95-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2007 Atıf Sayısı: 2
96-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2007 Atıf Sayısı: 5
97-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2007 Atıf Sayısı: 4
98-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2006 Atıf Sayısı: 3
99-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2006 Atıf Sayısı: 4
100-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2006 Atıf Sayısı: 3
101-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2005 Atıf Sayısı: 1
102-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2005 Atıf Sayısı: 8
103-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2005 Atıf Sayısı: 2
104-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2004 Atıf Sayısı: 2
105-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2004 Atıf Sayısı: 3
106-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2004 Atıf Sayısı: 2
107-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2003 Atıf Sayısı: 2
108-) Assignment of 1H, 13C, and 15N signals of turkey ovomucoid third domain at pH 2.0 - Atıf Yılı: 2003 Atıf Sayısı: 2
109-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2003 Atıf Sayısı: 2
110-) Assignment of 1H, 13C, and 15N signals of turkey ovomucoid third domain at pH 2.0 - Atıf Yılı: 2002 Atıf Sayısı: 1
111-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2002 Atıf Sayısı: 2
112-) Assignment of 1H, 13C, and 15N signals of turkey ovomucoid third domain at pH 2.0 - Atıf Yılı: 2001 Atıf Sayısı: 1
(F-1) Administered PhD/B.S./B.A. Dissertations.
1-) Tez Adı: TÜRKİYE MENŞELİ SIZMA ZEYTİNYAĞLARI İÇİN REFERANS NMR YÖNTEMLERİYLE OTANTİSİTE VE ORİJİN BELİRLEME METOTLARININ GELİŞTİRİLMESİ. Konu: Tez çalışması kapsamında Türkiye menşeli sızma zeytinyağları için Türkiyenin 11 farklı ilinden toplanan 300'ü aşkın zeytin örneğinden elde edilen NMR verileri kullanılarak bir data bankası oluşturulmuş ve oluşturulan bu data bankası kullanılarak zeytinlerin çeşitlerine ve coğrafi orijinlerine göre sınıflandırılmasına imkan veren yöntemler geliştirilmiştir. . Çağdaş-Dağ. 2016
(F-2) Administered graduate dissertations
1-) Tez Adı: RIG-I CARD1, RIG-I CARD2, RNF125-RING-FINGER ve TRIM25-SPRY domainlerinin yapısal çalışmalarda kullanılmak amacıyla üretilmesi ve NMR ile karakterizasyonu. Konu: RIG-I CARD1, RIG-I CARD2, RNF125-RING-FINGER ve TRIM25-SPRY domainlerinin yapısal çalışmalarda kullanılmak amacıyla üretilmesi ve NMR ile karakterizasyonu. Gül-Demir. 2013
2-) Tez Adı: ISG15 aktive edici E1 enzimi Ube1L-UF domaininin NMR solüsyon yapısının belirlenmesi ve bazı insan ubiquitilasyon E3 enzimlerinin ve RIG1-CARDs'ın klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması. Konu: ISG15 aktive edici E1 enzimi Ube1L-UF domaininin NMR solüsyon yapısının belirlenmesi ve bazı insan ubiquitilasyon E3 enzimlerinin ve RIG1-CARDs'ın klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması. Çağdaş-Dağ. 2012
3-) Tez Adı: Çeşitli ubiquitin aktive edici E1 enzimlerinin ubiquitin benzeri domainlerinin klonlanması, ekspresyonu, saflaştırılması ve izotopik olarak işaretlenmesi. Konu: Çeşitli ubiquitin aktive edici E1 enzimlerinin ubiquitin benzeri domainlerinin klonlanması, ekspresyonu, saflaştırılması ve izotopik olarak işaretlenmesi. Nazlı -Sökmen. 2007
(F-3)
1-) Tez Adı: JELATİN VE HİSTON KULLANILARAK DOKU MÜHENDİSLİĞİ UYGULAMALARI İÇİN YÜKSEK BİYOUYUMLU BİYOMALZEME SENTEZİ VE KARAKTERİZASYONU. Konu: JELATİN VE HİSTON KULLANILARAK DOKU MÜHENDİSLİĞİ UYGULAMALARI İÇİN YÜKSEK BİYOUYUMLU BİYOMALZEME SENTEZİ VE KARAKTERİZASYONU. Sabiha-Demirci-Cengiz. 2024
2-) Tez Adı: ELEKTRONANO DİYAGNOSTİK Leishmania PLATFORMLARI. Konu: ELEKTRONANO DİYAGNOSTİK Leishmania PLATFORMLARI. Benay-Perk. 2023
3-) Tez Adı: Co/2Fe MOF YAPISININ OKSİDAZ MİMİK ÖZELLİĞİ KULLANILARAK AMPEROMETRİK SİALİK ASİT BİYOSENSÖRLERİNİN GELİŞTİRİLMESİ. Konu: Co/2Fe MOF YAPISININ OKSİDAZ MİMİK ÖZELLİĞİ KULLANILARAK AMPEROMETRİK SİALİK ASİT BİYOSENSÖRLERİNİN GELİŞTİRİLMESİ. Okan-Avcı. 2023
4-) Tez Adı: NÖRAMİNİDAZ VE HEMAGLUTİNİN TEMELLİ ELEKTRO-NANO DİYAGNOSTİK PLATFORMLAR: INFLUENZA VE KANSER TANISINA YÖNELİK MODEL SİSTEMLERİN GELİŞTİRİLMESİ. Konu: NÖRAMİNİDAZ VE HEMAGLUTİNİN TEMELLİ ELEKTRO-NANO DİYAGNOSTİK PLATFORMLAR: INFLUENZA VE KANSER TANISINA YÖNELİK MODEL SİSTEMLERİN GELİŞTİRİLMESİ. Yudum-Tepeli Büyüksünnetçi. 2022
5-) Tez Adı: Escherichia coli’DE AŞIRI İFADE EDİLEN GENLERİN BOR TOLERANSINA ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI VE BORA BAĞLI GEN EKSPRESYON ANALİZLERİ. Konu: Escherichia coli’DE AŞIRI İFADE EDİLEN GENLERİN BOR TOLERANSINA ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI VE BORA BAĞLI GEN EKSPRESYON ANALİZLERİ. Esra-Dibek. 2020
6-) Tez Adı: Bor içeren yeni bir antibiotik epetroborale (AN3365)’e karşı duyarlı olan Escherichia coli mutantlarının KEIO koleksiyonunun taranması ile belirlenmesi. Konu: Bor içeren yeni bir antibiotik epetroborale (AN3365)’e karşı duyarlı olan Escherichia coli mutantlarının KEIO koleksiyonunun taranması ile belirlenmesi. Anara-Babayeva. 2019
7-) Tez Adı: NANOMALZEME MODİFİYE MİKROBİYAL YAKIT HÜCRELERİNİN GELİŞTİRİLMESİ. Konu: NANOMALZEME MODİFİYE MİKROBİYAL YAKIT HÜCRELERİNİN GELİŞTİRİLMESİ. Sema-Aslan. 2017
8-) Tez Adı: BUĞDAY (Triticum aestivum L.) 'IN ALÜMÜNYUM STRESİNE BAĞLI DIŞ ORTAMA METABOLİT SALINIMININ NÜKLEER MANYETİK REZONANS (NMR) SPEKTROSKOPİSİ İLE İNCELENMESİ. Konu: BUĞDAY (Triticum aestivum L.) 'IN ALÜMÜNYUM STRESİNE BAĞLI DIŞ ORTAMA METABOLİT SALINIMININ NÜKLEER MANYETİK REZONANS (NMR) SPEKTROSKOPİSİ İLE İNCELENMESİ. Kutbettin-Arslan. 2016
9-) Tez Adı: KLİNİK UYGULAMALARA YÖNELİK NANOYAPI TEMELLİ AMPEROMETRİK İMMÜNOSENSÖRLERİN GELİŞTİRİLMESİ. Konu: KLİNİK UYGULAMALARA YÖNELİK NANOYAPI TEMELLİ AMPEROMETRİK İMMÜNOSENSÖRLERİN GELİŞTİRİLMESİ. Sema-Aslan. 2013
10-) Tez Adı: ENZİMATİK BİYOANALİZLERİN İZLENMESİNE YÖNELİK ETKİN ELEKTROKİMYASAL YÖNTEMLERİN GELİŞTİRİLMESİ: BİYOSENTRİ- VOLTAMMETRİ VE NANOYAPI TEMELLİ SİSTEMLER. Konu: ENZİMATİK BİYOANALİZLERİN İZLENMESİNE YÖNELİK ETKİN ELEKTROKİMYASAL YÖNTEMLERİN GELİŞTİRİLMESİ: BİYOSENTRİ- VOLTAMMETRİ VE NANOYAPI TEMELLİ SİSTEMLER. Serdar-Çevik. 2013
(G-1) Principle Researcher in projects supported by international institutions
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: Propolise yanıtta rol oynayan E.coli genlerinin KEIO gen nakavt koleksiyonunun taranması ile belirlenmesi ve propolis ve aktif bileşenlerinin etki mekanizmalarının NMR metabolomik yöntemler ile araştırılması.. Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Propolise yanıtta rol oynayan E.coli genlerinin KEIO gen nakavt koleksiyonunun taranması ile belirlenmesi ve propolis ve aktif bileşenlerinin etki mekanizmalarının NMR metabolomik yöntemler ile araştırılması.. 2019-2027
(G-2) Being part of a project supported by international institutions (researcher, trainer, advisor, etc.)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Diğer(Uluslararası). Structure of the human chemokine lymphotactin. 1998-2002
(G-3)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. İnsan ISG15 konjugasyon sisteminde aktive edici E1 enzimi Ube1L grasp domaininin E2 enzimi ile etkileşiminde konformasyonel esnekliğin rolünün belirlenmesi. 2013-2014
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Ubiquitin aktive edici E1 enziminin HsUba1a ubiquitin benzeri domaininin üç boyutlu yapısının ve ubiquitin konjugasyon sistemindeki diğer bileşenler ile ektileşmelerinin Nükleer Manyetik Rezonans NMR yöntemleri ile belirlenmesi. 2005-2010
(G-4)
1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1001. Genomik, Proteomik, Metabolomik ve Moleküler yaklaşımlarla Bacillus subtilis'te Bor ile ilgili genlerin ve biyomoleküllerin araştırılması. 2024-2027
2-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1001. Bazı Fenolik Asitlerin Escherichia coli Üzerindeki Etkilerinin Genom, Çözünür Proteom ve Metabolom Düzeyinde Moleküler ve Biyokimyasal Yaklaşımlar Kullanılarak Araştırılması. 2022-2025
3-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Çeşitli bis ligandlar içeren geçiş metal kompleksleri Sentez karakterizasyon DNA bağlama ve DNA kesme özellikleri. 2012-2014
4-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Deterjan sanayi için daha stabil yeni bir lipaz arayışı. 2011-2013
5-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Ube1L UFD ve UbcH8 proteinlerinin pET DUET1 ko ekspresyon vektörü içerisine klonlanması ko ekspresyonu ve saflaştırılması. 2011-2012
6-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. İnsan ISG15 ve ubiquitin E2 enzimlerinin klonlanması ekspresyonu ve yapısal çalışmalarda kullanılmak üzere 15N ve 13C işaretli olarak üretilmesi. 2008-2009
(G-6)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Yeni azo bileşiklerinin ve azo metal komplekslerinin sentezi DNA bağlama ve kesme özelliklerinin belirlenmesi. 2010-2011
(G-7)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Uba3 beta grasp domaininin E2 enzimleri ile etkileşiminde konformasyonel esnekliğin öneminin araştırılması. 2012-2014
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. RIG1 CARD1 ve RIG 1 CARD2 RNF125 ring finger ve Trim25 SPRY domainlerinin yapısal çalışmalarda kullanılmak amacıyla üretilmesi ve NMR ile karekterizasyonu. 2012-2013
3-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. RNF125 RIG I CARDS ve Trim25 SPRY domainlerinin klonlanması üretimi ve saflaştırılması. 2010-2011
(G-8)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Buğday Triticum aestivum L Köklerinde Alüminyum Stresine Bağlı Metabolit Değişimlerinin Nükleer Manyetik Rezonans NMR Spektroskopisi ile İncelenmesi. 2013-2015
(I-6)
1-) Nanoyapı modifiye elektrokimyasal ve biyoelektrokimyasal sistemler. Muğla, Türkiye. . 2013
2-) 26. Ulusal Kimya Kongresi- Biyokimya oturum başkanlığı . Muğla, Türkiye. . 2012
3-) TUSSİDE-Tubitak Proje Yönetimi Uygulamalı Çalıştay. Türkiye. . 2005
(I-7)
1-) Turkish NMR Meeting . Türkiye. Türkiye . 2012
2-) International workshop on “Modern Techniques in Structural Biology. ICCBS, University of Karachi, Pakistan. . 2011