(A-1) Articles published in journals indexed by SCI or SCI Expanded, SSCI, AHCI
1-) Baysal Ö., Genç D., Silme R. S., Kırboğa K. K., Çoban D., Ghafoor N.a, Tekin L., Bulut O., 2024. Targeting Breast Cancer with N-Acetyl-D-Glucosamine: Integrating Machine Learning and Cellular Assays for Promising Results. Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry
2-) Baysal Ömür, Studholme David J., Jimenez-quiros Catherine, Tör Mahmut, 2024. Genome sequence of the plant-growth-promoting bacterium Bacillus velezensis EU07. Access Microbiology
3-) Silme Ragıp Soner, Zebro Marcello, Mercati Francesco, Karataş Ali, Baştaş Kubilay Kurtuluş, Carimi Francesco, Baysal Ömür, 2024. Molecular tracking of Acidovorax citrulli: Unveiling pathogen dynamics and blotch disease outbreaks through specific markers. Genetika
4-) Ghafoor Naeem Abdul, Kırboğa Kevser Kübra, Baysal Ömür, Süzek Barış Ethem, Silme Ragıp Soner, 2023. Data mining and molecular dynamics analysis to detect HIV-1 reverse transcriptase RNase H activity inhibitor. Molecular Diversity
5-) Kniazeva Volha, Tzerkovsky Dzmitry, Baysal Ömür, Kornev Alexander, Roslyakov Evgeny, Kostevitch Serhei, 2023. Adjuvant composite cold atmospheric plasma therapy increases antitumoral effect of doxorubicin hydrochloride. Frontiers in Oncology
6-) Çetinkaya Agit, Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, Azim Kamran, Saleem Faizan, 2022. Genomic characterization and phytostimulative effect of a novel Serratia species. Genetika-Belgrade
7-) Jimenez-quiros Catherine, Okechukwu Emeka C., Hong Yiguo, Baysal Ömür, Tör Mahmut, 2022. Comparison of Antifungal Activity of Bacillus Strains against Fusarium graminearum In Vitro and In Planta. Plants-Basel
8-) Baysal Ö., Ghaafour N. A., Silme R .s., Ignatov A. N., Kniazeva V., 2021. Molecular dynamics analysis of N-acetyl-D-glucosamine against specific SARS-CoV-2's pathogenicity factors. PloS ONE
9-) Şener Burak, Baysal Ömür, Nadeem Saıd, Silme Ragıp Soner, 2021. Synthesis of Adenine-based Fluorescent and Naked-eye Chemosensors: Specific DNA Probes for the Detection of Bacterial Pathogens. Acta Chimica Slovenica
10-) Kniazeva Volha, Baysal Ömür, Krasko Anatoli, Iwaniak Wojciech, Higgs Stephen, 2021. The Prevalence and Genetic Characterization of Strains of Borrelia Isolated from Ixodes Tick Vectors in Belarus (2012\u20132019). Vector-Borne and Zoonotic Diseases
11-) Yılmaz M., Baysal Ö., Silme R. S., 2021. The effect of a seed coating with Origanum vulgare essential oil on Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis. Plant Protection Science
12-) Ağdamar Sevan, Baysal Ömür, Yıldız Ayşegül, Tarkan Ali Serhan, 2020. Genetic differentiation of non-native populations of Gibel Carp, Carassius gibelio in Western Turkey by ISSR and SRAP markers. Zoology in the Middle East
13-) Polat İlknur, Baysal Ömür, Gümrükçü Emine, Sülü Görkem, Kitapcı Aytül, Özalp Ramazan, Çelik İbrahim, Devran Zübeyir, Polat Ersin, 2018. Molecular diversity and assessment of reactions of pepper pure line germplasm to Botrytis cinerea. Plant Protection Science
14-) Polat İlknur, Baysal Ömür, Mercati Francesco, Gümrükcü Emine, Sülü Görkem, Kitapcı Aytül, Aranıtı Fabrızıo, Carımı Francesco, 2018. Characterization of Botyritis Cinerea isolates collected on pepper in Suthern Turkey by using molecular markers, fungucide resistance genes and virulence assay. Infection Genetics and Evolution
15-) Devran Zübeyir, Polat İlknur, Mıstanoğlu İbrahim, Baysal Ömür, 2018. A novel multiplex PCR tool for simultaneous detection of three root-knot nematodes. Australasian Plant Pathology
16-) Gürüler, H., Peker, M., Baysal, Ö., 2015. Soft computing model on genetic diversity and pathotype differentiation of pathogens: A novel approach In press. Electronical Journal of Biotechnology
17-) Baysal, Ö., Tör, M., 2014. Smart Biologics For Crop Protection in Agricultural Systems.. Turkish Journal of Agricultural and Forestry
18-) Ağdamar, S., Tarkan, A.S., Keskin, E., Top, N., Doğaç, E., Baysal, Ö., Emiroğlu, Ö., 2014. The role of environmental factors and genetic diversity on colonization success of a non-native fish, Lepomis gibbosus from western part of Turkey.. Biochemical Systematics and Ecology
19-) Bozkurt, A.İ., Soylu, S., Mirik, M., Ulubaş, S., Baysal, Ö., 2014. Characterization of bacterial knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi on pomegranate (Punica granatum L.) trees: a new host of the pathogen.. Letters in Applied Microbiology
20-) Polat, İ., Baysal, Ö., Mercati, F., Kitner, M., Cohen, Y., Lebeda, A., Carimi, F., 2014. Characterization of Pseudoperonospora cubensis isolates from Europe and Asia using ISSR and SRAP molecular markers.. European Journal of Plant Pathology
21-) Baysal, Ö., Lai, D., Xu, H.H., Siragusa, M., Çalışkan, M., Carimi, F., Teixeira. Da Silva, J.A., Tör, M., 2013. A proteomic approach provides new insights into the control of soil-borne plant pathogens by Bacillus species.. PLOS ONE
22-) Baysal, Ö., Karaarslan, Ç., Siragusa, M., Alessandro, R., Carimi, F., Pasqalue, F.D., Teixeira. Da Silva, J.A., 2013. Molecular markers reflect differentiation of Fusarium oxysporum forma speciales on tomato and forma on eggplant.. Biochemical Systematics and Ecology
23-) Devran, Z., Baysal, Ö., 2012. Genetic characterization of Meloidogyne incognita isolates from Turkey using sequence-related amplified polymorphism. Biologia
24-) Erdoğan, O., İkten, H., Baysal, Ö., 2011. Molecular diversity within Pseudomonas fluorescens strains reflects their antagonistic effect differentiations to Verticillium dahliae on cotton. . Romanian Biotechnological Letters
25-) Baysal, Ö., Mercati, F., İkten, H., Çetinkaya, R., Aysan, Y., Carimi, F., Teixeira. Da Silva, J.A., 2010. Clavibacter michiganensis subsp. michiganesis: Tracking Strains Using Their Genetic Differentiations by ISSR Markers in Southern Turkey .. Physiological and Molecular Plant Pathology
26-) Baysal, Ö., Siragusa, M., Gümrükçü, E., Zengin, S., Carimi, F., Sajeva, M., Teixeira. Da Silva, J.A., 2010. Molecular Characterization of Fusarium oxysporum f. melongenae virulence by ISSR and RAPD Markers on Eggplant.. Biochemical Genetics
27-) Baysal, Ö., Siragusa, M., İkten, H., Polat, İ., Gümrükçü, E., Yiğit, F., Carimi, F., Teixeira Da Silva, J., 2009. Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici races and their genetic discrimination by molecular markers in West Mediterranean region of Turkey. . Physiological and Molecular Plant Pathology
28-) Baysal, Ö., Çalışkan, M., Yeşilova, Ö., 2008. An inhibitory effect of a new Bacillus subtilis strain (EU07) against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici.. Physiological and Molecular Plant Pathology
29-) Baysal, Ö., Gürsoy, Y.Z., Örnek, H., Çetinel, B., Teixeira Da Silva, J.A., 2007. Enhanced systemic resistance to bacterial speck disease caused by Pseudomonas syringae pv. tomato by dl-ß-aminobutyric acid under salt stress . Physiologia Plantarum
30-) Baysal, Ö., Gürsoy, Y.Z., Örnek, H., Duru, A., 2005. Induction of oxidants in tomato leaves treated with DL-ß- Amino butyric acid (BABA) and infected with Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis . European Journal of Plant Pathology volume
31-) Baysal, Ö., Gürsoy, Y.Z., Örnek, H., Çetinel, B., 2005. Enhancing tomato resistance to bacterial canker by turtle oil. . General Plant Pathology
32-) Baysal, Ö., Gürsoy, Y.Z., Örnek, H., 2005. Acibenzolar-S-methyl Induce Resistance in Pepper Leaves against Phytophthora capsici (Leonian). Biologia Plantarum
33-) Soylu, E.M., Yiğitbaş, H., Tok, F.M., Soylu, S., Kurt, Ş., Baysal, Ö., Kaya, A..D., 2005. Chemical composition and antifungal activity of the essential oil of Artemisia annua L. against foliar and soil-borne fungal pathogens . Zeitschrift für Pflanzenkrankheiten und Pflanzenschutz / Journal of Plant Diseases and Protection
34-) Baysal, Ö., Zeller, W., 2004. Extract of Hedera helix induces resistance on apple rootstock M26 similar to Acibenzolar-S-methyl against Fire Blight (Erwinia amylovora) . Physiological and Molecular Plant Pathology
35-) Baysal, Ö., Soylu, S., Soylu, E.M., 2003. Induction of defense-related enzymes and resistance by the plant activator acibenzolar-S-methyl in tomato seedlings against bacterial canker caused by Clavibacter michiganensis ssp.michiganensis . Plant Pathology
36-) Soylu, E.M., Soylu, S., Baysal, Ö., 2003. Induction of disease resistance and antioxidant enzymes by acibenzolar-S-methyl against bacterial wilt disease (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato. . Journal of Plant Pathology
37-) Soylu, S., Baysal, Ö., Soylu, E.M., 2003. Induction of disease resistance by the plant activator, acibenzolar-S-methyl (ASM), against bacterial canker (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato seedlings . Plant Science
(A-2) Technical Notes, Letters to the Editor, Discussions and Abstracts published in journals indexed by SCI or SCI-Expanded , SSCI, AHCI
1-) Jimenes Quiros C, Baysal Ömür, Nicholson Paul, Mahmut Tor, 2018. Determining the antifungal activity of Bacillus species against Fusarium graminearum. PHYTOPATHOLOGY
2-) Devran Zübeyir, Baysal Ömür, 2018. Induction of resistance to Meloidogyne incognita by DL-Beta amino butyric acid under salt stress condition. Australasian Plant Disease Notes
3-) Alataş Emine Tuğba, Kara Asude, Kara Murat, Doğan Gürsoy, Baysal Ömür, 2017. Ectodermal dysplasia-skin fragility syndrome with a new mutation. Indian Journal of Dermatology, Venereology, and Leprology
4-) Gümrükcü, E., Polat, İ., Sülü, G., Kitapcı, A., Baysal, Ö., 2016. First Report of Grey Mold Caused by Botryotinia fuckeliana on Golden Berry. PLANT DISEASE
5-) İçöz, S.M., Polat, İ., Sülü, G., Yılmaz, M., Ünlü, A., Soylu, S., Bozkurt, İ.A., Baysal, Ö., 2014. First Report of Bacterial Blight of Pomegranate Caused by Xanthomonas axonopodis pv. punicae in Turkey.. American Plant Disease
6-) Baysal, Ö., Lai, D., Xu, H.H., Huang, Q.L., Yiğit, F., 2011. Control of late blight disease on tomato by cyclic lipopeptides of Bacillus subtilis strain (EU07).. Current Opinion in Biotechnology
7-) Baysal, Ö., Laux, P., Zeller, W., 2002. Studies on induced resistance (IR) effect of the plant extract from Hedera helix against fire blight. . Acta Hortuculturae
(A-3)
1-) Baysal Ö., R. S. Silme, Karaaslan C., A. N. Ignatov, 2021. Genetic uniformity of a specific region in SARS-CoV-2 genome and repurposing of N-acetyl-D- glucosamine. Fresenius Enviromental Bulletin
2-) Ünlü Abdullah, Baysal Ömür, Polat İlknur, Sülü Serap Melike, İkten Hatice, Devran Zübeyir, Gümrükcü Emine, 2017. Batı Akdeniz Bölgesi örtüaltı yetiştiriciliğinde sorun olan domateste Bakteriyel Benek (Pseudomonas syringae pv. tomato “Okabe” Y.D.W) hastalık etmeni izolatlarının genetik farklılıklarının moleküler yöntemlerle tespiti. derim
3-) Zengin Talip, Kılıç Sercan, Yenigün Ufuk, Serhat Erdoğmuş, Baysal Ömür, 2017. A Smart Way for Talking With Proteins Proteomics. MOJ Proteomics Bioinformatics
4-) Silme, R.S., Baysal, Ö., 2016. Biodegradation of essential oil by Enterobacter spp. induces plant growth and inhibits damping-off pathogens . Fresenius Environmental Bulletin
5-) Baysal, Ö., 2013. Assessing intra-specific variation within Bacillus species using DNA fingerprinting.. Fresenius Environmental Bulletin
(A-3-Eski) Articles published in journals indexed by international indexes other than SCI or SCI Expanded, SSCI, AHCI
1-) Baysal Ömür, Yıldız Ayşegül, 2017. Bacillus Subtilis: An Industrially Important Microbe for Enzymes Production. EC Microbiology
(A-5) Articles published in journals indexed by international indexes other than SCI or SCI Expanded, SSCI, AHCI
1-) Polat İlknur, Sülü Görkem, Kitapcı Aytül, Gümrükcü Emine, Baysal Ömür, 2018. Molecular fingerprinting of Botrytis cinerea population structure from different hosts. Derim
(A-7)
1-) Yılmaz, M., Kavak, S., Baysal, Ö., 2014. Bazı ticari sabit ve uçucu yağların domates bakteriyel kanser ve solgunluk etmeni üzerine antibakteriyel etkileri.. DERİM
2-) Yiğit, F., Baysal, Ö., Özkan, Y., 2011. Domates seralarında Kurşuni Küf hastalığının Biyolojik ve Kimyasal Kontrolünde Borun Arttırıcı Etkisi. Selçuk Tarım ve Gıda Bilimleri
3-) Baysal, Ö., 2004. Recombinant DNA and Gene Cloning Technology in Agricultural Plant Protection . Türkiye Bitkisel Araştırmalar Dergisi
4-) Baysal, Ö., Gürsoy, Y.Z., Yıldız, F., 2004. Bazı Önemli Bitki Hastalıklarıyla Savaşımda Beta DL- Aminobütrik asitten yararlanma olanakları . Anadolu
5-) Baysal, Ö., Gürsoy, Y.Z., 2003. Dayanıklılık Artırıcı Bitki Aktivatörü Acibenzolar-S- methyl (ASM)’ in Domates Hastalık ve Zararlılarıyla Savaşımda Kullanım Olanakları
. Alatarım
(A-8) Articles published in Refereed National Journals
1-) Silme, R.S., Gümrükçü, E., Özkan, C.F., Baysal, Ö., 2015. Anız Yakmanın Toprakta Mikroflora Dinamiğine Olan Etkileri.. Elektronik Mikrobiyoloji Dergisi
(B-1) Papers verbally presented or published in scientific and art meetings like international conferences, symposiums, panels, and workshops
1-) Baysal Ömür, 2022. Stress Regulation by Microbial Cells. ICLIC 2022 INTERNATIONAL CONGRESS OF CILIMATE CHANGE EFFECTS ON HEALTH, LIFE, ENGINEERING AND SOCIAL SCIENCES
2-) Arzıman Süleyman, Zengin Talip, Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2017. In-silico analysis on gene sequence encoding type III effector proteins reflect similar host- speciation for bacterial pathogens infecting tomato. 4th ICSAE
3-) Baştaş Kubilay Kurtuluş, Baysal Ömür, 2017. Screening of Erwinia amylovora strains considering gene sequencing of pathogenic islands. 4th International Conference on Sustainable Agriculture and Environment
4-) Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2017. Proteomic tools in plant pathology for sustainable agriculture. 4th ICSAE
5-) Soylu, S., Soylu, E.M., Baysal, Ö., Zeller, W., 2006. Antibacterial activities of essential oils from medicinal plants against the growth of Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis . First International Symposium on Biological Control of Bacterial Diseases Darmstadt- Germany Berichte Biol. Bundesanst. Land- Forstwirtsch.
6-) Soylu Soner, Soylu Emine Mine, Baysal Ömür, Zeller Wolfgang, 2006. Antibacterial activities of the essential oils from medicinal plants against the growth of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis. Biocontrol of Bacterial Plant Diseases, 1st Symposium 2005
7-) Yılmaz, M., Sülü, S.M., Kavak, S., Baysal, Ö., 2005. Seed Health and Film Coating.. XVIII. International Plant Protection Congress, p 477, Free University, 24–27 August 2015, Berlin, Germany.
8-) Baysal, Ö., Laux, P., Zeller, W., 2005. Baysal, Ö., Laux, P. and Zeller, W. (2002). Further Studies on induce resistance (IR) effect of plant extract from Hedera helix against Fire Blight (E. amylovora). Acta Hort. (ISHS) 590: 273-277 . IX International Workshop on Fire Blight
9-) Baysal Ö., YZ. Gürsoy, H. Örnek, A. Duru, S. Soylu, M. Soylu, W. Zeller (2005). Induction of oxidative burst in tomato leaves treated with unsaturated fatty acids of turtle oil (Caretta caretta) against Pseudomonas syringae pv. tomato. In: First International Symposium on Biological Control of Bacterial Diseases Darmstadt- Germany Berichte Biol. Bundesanst. Land- Forstwirtsch. 128 p. - 2005
10-) Baysal, Ö., Laux, P. and Zeller, W. (2002). Systemic acquired resistance (SAR) –effect of BTH against fire blight. Acta Hort. (ISHS) 590:269-272 - 2002
11-) Baysal, Ö. Laux, P. Zeller W. (2002). Control of fire blight (Erwinia amylovora) with the plant activator BTH. In Proceeding IOBC/WPRS- Kusadası Biological Control of Fungal and Bacterial Plant Pathogens Vol: 25(10) pp. 135-138. - 2002
12-) Laux, P., Baysal, Ö., Zeller, W., 2002. Laux, P., Baysal, Ö. and Zeller, W. (2002). Biological control of Fire blight by using Rahnella aquatilis Ra39 and Pseudomonas spec. Acta Hort. (ISHS) 590:225-230 . IX. International Workshop Fire Blight
13-) Baysal, Ö., and Zeller W. (2000). Studies on control of fire blight (Erwinia amylovora) with the plant activator BION®. In Proceeding of 10th International Conference Plant Pathogenic Bacteria in Canada Kluwier Academic Publishers p.324-331. - 2000
(B-2)
1-) Bayraktar Abdulahad, Süzek Tuğba, Süzek Barış Ethem, Baysal Ömür, 2019. A Meta-analysis of Gene Expression Data in Neurodegenerative Diseases. The 6th International Workshop onComputational Network Biology: Modeling, Analysis, and Control(CNB-MAC 2019)
2-) Silme Ragıp Soner, Baysal Ömür, Nadeem Saıd, 2018. Biosensor for Plant Pathogen DNA Detection with Gold Nanoparticles as Probes. 1st International Eurasian Conference on Biological andChemical Sciences (EurasianBioChem 2018)
3-) Silme Ragıp Soner, Baysal Ömür, Nadeem Saıd, 2018. The Antimicrobial Effect of Essential Oilsfrom Thymus vulgaris and Origanum vulgare on Klebsiella pneumoniae an ecofriendly approach. 1st International Eurasian Conference on Biological andChemical Sciences (EurasianBioChem 2018)
4-) Nadeem Said, Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, 2017. Antibacterial effect of DNA- directed silver nanoparticles on graphene oxide. 1. International University Industry cooperation RD and innovation congress
5-) Silme Ragıp Soner, Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2017. Use of artificial intelligence for predicting the evolution of fungicide resistance. 4th ICSAE
6-) Baysal Ömür, Gürüler Hüseyin, Tarkan Ali Serhan, 2017. Use of artificial intelligence for prediction of genetic diversity and ecological behaviour within invasive species. II. WORKSHOP ON INVASIVE SPECIES: Global meeting on invasion ecology
7-) Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2017. Omics Sciences and Plant Pathology. International WorkshopPlant Health: Challenges and Solutions
8-) Silme Ragıp Soner, Nadeem Said, Baysal Ömür, 2017. Entrepreneurship activities at universities. 1. International University Industry cooperation RD and innovation congress
9-) Demircan Çiğdem Sinem, Ercan Menekşe Didem, Baysal Ömür, 2017. Mutation screening on genes encoding adenylate cylase and Rhs elements for Sulphametoxazol- trimethoprim resistance on Vibrio anguillarum. International Conference on Agriculture, Forest, Food Sciences and Technologies (ICAFOF 2017)
10-) Baysal Ömür, 2017. Industrial potential of a new Bacillus subtilis (EU07) besides its biocontrol property. International conference of applied sciences, enginnering and mathematics ıcasem 2017
11-) Yilmaz, M., Sülü, S. M., Kavak, S., & Baysal, Ö. (2015). Seed Film Coating with Commercial Essential Oils against to Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis and its efficiency on tomato seed and seedling quality in seedling company conditions. International Plant Protection Congress, p 478, Free University, 24–27 August 2015, Berlin, Germany. - 2015
12-) Polat İ., Gümrükcü E., Sülü G., Kitapcı A., Özalp R., Çelik İ., Devran Z., Polat E. and Baysal Ö., 2015. Molecular Characterization of Fungicides Resistance of Botrytis Cinerea on Pepper and Host -Resistance of Selected Breeding Materials. “COST Action Sustain FA1208. Evolutionary Genomics of Plant Pathogens” Workshop, 26-28 August 2015, Kiel, Germany. Poster, Page: 49 - 2015
13-) Yılmaz M., İçöz S.M., Aras V., Kavas S. and Baysal Ö. (2013) Investigation on use of apple cider and wine vinegar for seed disinfection to control of bacterial fruit blotch (BFB) as a seed coating material. 30th ISTA (International Seed Testing Association )Congress, Seed Symposium Abstracts p.98 of 124. - 2013
14-) Polat I., R. Kurum, Ö. Baysal, Y. Cohen and A. Lebeda (2012) Genetic characterization of isolates of Pseudoperonospora cubensis causing downy mildew in different countries using molecular markers Cucurbitaceae Proceedings of the Xth EUCARPIA meeting on genetics and breeding of Cucurbitaceae (eds. Sari, Solmaz and Aras) Antalya (Turkey), October 15-18th. - 2012
15-) Devran, Z., Baysal Ö. (2010). Use of SRAP analysis for genetic variation in Meloidogyne incognita. Pp. 108. - 2010
16-) Yılmaz M,, Baysal Ö., and Zeller W. (2010). Assessing of Some Essential Oils Efficiency to Control of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis on Tomato (L. esculentum L.) 29. ISTA 2010 Seed Congress &Sympossium/Cologne/Germany P.35 - 2010
17-) Baysal Ö., İkten H., Çalışkan M. (2008) An efficient method in order to discrimination of genetical differences of biological control agents by molecular ISSR and RAPD markers. 2. International Symposium on Biocontrol of Bacterial Disease, Orlando Florida, USA Proceeding abstracts pp. 27. - 2008
18-) Baysal Ö., M. Çalışkan, Ö. Yeşilova (2007). Performance of EU07 in biological control of Fusarium oxysporum f.sp. radicis lycopersici. Second International Tomato Disease Symposium Kusadası -Turkey. 8- 12 October Kusadası-Turkey. Proceeding abstracts s.77 - 2007
(B-3)
1-) Kurum Y. Şener B., Bozkurt E. B., Korkut A., Kayran G., Savran S., Baştaş K. K., Baysal Ö., 2019. Tracking major plant pathogenic bacteria using microsatellites derived from full genome sequence analysis . 6th International Conference on Sustainable Agriculture and Environment
2-) E. Gümrükçü, Ö. Baysal, A. Ünlü, M. Yılmaz and N. Karatekin (2012) Investigations on inhibitory effects of some essential oils against Fusarium oxysporum f. sp. melonis races on melon Cucurbitaceae Proceedings of the Xth EUCARPIA meeting on genetics and breeding of Cucurbitaceae (eds. Sari, Solmaz and Aras) Antalya (Turkey), October 15-18th. - 2012
3-) Devran Z. , Baysal Ö. , Söğüt M. A. (2010). Induction of resistance to root knot nematode by DL-Amino butyric acid treatment Pp. 143 - 2010
4-) Baysal Ö., Ö. Yeşilova (2007). Low abiotic stress leads to priming by DL- aminobutyric acid (BABA) treatment against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici Second International Tomato Disease Symposium 8-12 October Kusadası -Turkey. Proceeding abstracts s.95 - 2007
(B-4) Papers verbally presented or published in scientific and art meetings like national conferences, symposiums, panels, and workshops
1-) Ağdamar Sevan, Ünal Ayşegül, Baysal Ömür, Tarkan Ali Serhan, 2019. İstilacı Bir Türün Genetik Varyasyon Analizi: Gümüşi Havuz Balığı’nda ISSR ve SRAP Markörlerinin İlk Kullanımı. 20. Ulusal Su Ürünleri Sempozyumu (2019)
2-) Baysal Ö., Baştaş K. K., 2019. In -silico shotgun metagenomics data comparison expands the number of possible candidates to be used for biocontrol of fire blight disease . International biological, agricultural and life science congress
3-) Özkan C.F., Baysal Ö., Coşkun R., 2011. Atmosfere Karbon Salınımı Ve Toprak Organik Maddesi Arasındaki İlişkiler. I. Ulusal Akdeniz Orman Ve Çevre Sempozyumu 26-28 Ekim 2011, Kahramanmaraş. S:1209-1216. - 2011
4-) Baysal Ö., İkten H., Polat İ., Gümrükçü E., Çelik N., Ünlü A. (2009) Organik tarımda hastalıklarla mücadelede kullanılan biyolojik ajanların moleküler yöntemlerle karekterizasyonu. 1. GAP Organik Tarım Kongresi 17- 20 Kasım. Bildiri Özetleri s. 186. - 2009
(B-5)
1-) Polat İ., Gümrükcü E., Sülü G., Kitapcı A., Özalp R., Çelik İ., Devran Z., Polat E. and Baysal Ö. (2015) Örtüaltı Biber Yetiştiriciliğinde Görülen Kurşuni Küf Hastalığına Neden Olan Botrytis cinerea İzolatlarının Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Tanımlanması. VII. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi. 25-29 Ağustos 2015, Çanakkale. Sayfa:190. - 2015
2-) Baysal Ö., İkten H., Polat İ., Gümrükcü E., Ünlü A., Yiğit F. (2009) Batı Akdeniz bölgesi domates üretim seralarında Fusarium oxysporum türlerinin moleküler tekniklerle teşhisi ve ırk ayırımı Türkiye III. Bitki Koruma Kongresi, s. 182 - 2009
3-) Yiğit F., Baysal Ö., Özkan Y. Y. (2009) Domateste kurşuni küf hastalığının biyolojik ve kimyasal kontrolü üzerine borun etkisi. Türkiye III. Bitki Koruma Kongresi, Bildiri Özetleri s. 183. - 2009
4-) Baysal Ö, Gürsoy, Z.Y and Soylu S. (2004) Domates Bitkisinde Bakteriyel Benek Hastalığına Karşı Dayanıklılığın DL-ß-Amino butyric asit (BABA) Tarafından Teşvik Edilmesi I. Bitki Koruma Kongresi Samsun s.150. - 2004
5-) Baysal, Ö., and Zeller, W.(2000). Untersuchungen mit dem Pflanzenaktivator BION (BTH) II. Jahresbericht Biologische Bundesanstalt für Land- und Forstwirtschaft Institut für biologischen Pflanzenschutz. pp. 256 - 2000
6-) Baysal, Ö., and Zeller, W. (2000). Untersuchungen zur Bekämpfung des Feuerbrandes mit dem Pflanzenaktivator BION® und zu seinem Wirkungsmechanismus.52. Deutsche Pflanzenschutztagung in Freising – Weihenstephan 9-12 Oktober, 408. - 2000
7-) Baysal, Ö. and Zeller W. (2000). Studies on plant activator BION® against fire blight.In der Arbeitskreis Phytobakteriologie Phytomedizin Nr.1. p. 25 - 2000
8-) Baysal, Ö., and Zeller, (2000). W. Systemic acquired resistance induced by BION® in Apple Rootstocks after Inoculation with fire blight. Arbeitskreis Phytopharmakologie Phytomedizin Nr.2- Juni ,40 - 2000
9-) Baysal, Ö., and Zeller, W.(1999). Untersuchungen mit dem Pflanzenaktivator BION® (BTH) I. Jahresbericht. Biologische Bundesanstalt für Land- und Forstwirtschaft Institut für biologischen Pflanzenschutz pp-260 - 1999
(B-6)
1-) Yılmaz M., İçöz S. M., Ünlü A., Baysal Ö. (2014) Nanobakırın Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis ve domates tohum canlılığı üzerine etkisinin belirlenmesi. Türkiye V. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri , Antalya S.223. - 2014
(C-1) Books published by publishing houses internationally renowned in the relevant field
1-) S. Yılmaz, Göcmen M., Ünlu A., Aydınsakir K , Mutlu N. , Baysal Ö. ...devran Z. , Tekşam İ. , 2008. Phasing Out Methyl Bromide in Turkey/. Yayın Evi: Kutlu Avci Ofset Form Baski Reklam San. ve Tic. Ltd. Şti. Editör Adı: Yılmaz, S., Göçmen, M., Ünlü, A., AYDİNŞAKİR, K., Mutlu, N., Baysal, Ö., Sayın, B.,Çelikyurt, M.A., Çelik, İ., Aktaş, A., Öztop, A., Zengin, S., Devran, Z. And Tekşam, İ.,
(C-3) Book Chapters published by publishing houses internationally renowned in the relevant field
1-) Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2023. Microbial Biocontrol: Molecular Perspective in Plant Disease Management/The Exploitation of Recombinant DNA Technology to Induce Biologics Directed to Biocontrol. Yayın Evi: Springer Editör Adı: Bastas Kubilay Kurtulus, Kumar Ajay ,Sivakumar U.
2-) Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2022. Microbial Biocontrol: Sustainable Agriculture and Phytopathogen Management/Host-Induced Gene Silencing: Approaches in Plant Disease Management. Yayın Evi: Springer Editör Adı: Ajay Kumar
3-) Çetinel Barbaros, Zemran Mustafa, Andaç Özketen Ayşe, Özketen Ahmet Çağlar, Baysal Ömür, 2022. Phytomycology and Molecular Biology of Plant–Pathogen Interactions/Fungal Genome and Genomics. Yayın Evi: Taylor and Francis CRC press Editör Adı: Imran Ul Haq, Siddra Ijaz, Iqrar Ahmad Khan
4-) Baysal Ö. , Bastas K., 2022. Host-Induced Gene Silencing: Approaches in Plant Disease Management. In: Kumar, A. (eds) Microbial Biocontrol: Sustainable Agriculture and Phytopathogen Management. Springer,. Yayın Evi: Springer, London/Berlin Editör Adı: Kumar, A. (eds)
5-) Baştaş Kubilay, Baysal Ömür, 2022. Microbial Biocontrol: Sustainable Agriculture and Phytopathogen Management/Microbial Battling of Fire Blight Disease on Pome Fruits. Yayın Evi: Springer Editör Adı: Ajar Kumar
6-) Silme R. Soner, Baysal Ö., 2021. Volatiles and Metabolites of Microbes/Bacterial volatile organic compounds and gene-induced host-defense pathways. Yayın Evi: Academic Press, London Editör Adı: Kumar Ajay ,Singh Joginder, Samuel Jastin
7-) Baysal Ö. , Silme R. S., 2021. Origin and Impact of COVID-19 Pandemic Originating From SARS-CoV-2 Infection Across the Globe/Utilization from Computational Methods and Omics Data for Antiviral Drug Discovery to Control of SARS-CoV-2. Yayın Evi: IntechOpen Limited, London Editör Adı: Veas Francisco
8-) Silme Ragıp Soner, Baysal Ömür, 2020. Biogenic Nano-Particles and their Use in Agro-ecosystems/A Missing Dilemma on Nanoparticle Producer Microorganisms. Yayın Evi: Springer, Singapore Editör Adı: Mansour GhorbanpourPrachi BhargavaAjit VarmaDevendra K. Choudhary
9-) Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, 2019. Mycorrhizosphere and Pedogenesis/The Beneficial Influence of Microbial Interactions on Plant Diseases and Plant Growth Promoting Effect. Yayın Evi: Springer Nature Singapore Pte Ltd. Editör Adı: Varma A., Choudhary DK.
10-) Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, 2019. Plant Competition in Cropping Systems/The Ecological Role of Biodiversity for Crop Protection. Yayın Evi: IntechOpen Limited Editör Adı: Daniel Dunea
11-) Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, 2017. Volatiles and Food Security Role of Volatiles in Agro-ecosystems/Bacterial Volatile in Rhizosphere. Yayın Evi: Springer Singapore Editör Adı: Choudhary D.K., Sharma A.K., Agarwal P., Varma A., Tuteja N.
12-) Baysal Ömür, 2015. Sustainable Approaches to Controlling Plant Pathogenic Bacteria/Host Resistance: SAR and ISR to Plant Pathogenic Bacteria. Yayın Evi: CRC Press Editör Adı: V. Rajesh Kannan, Kubilay Kurtulus Bastas
13-) Baysal Ömür, 2006. Floriculture Ornamental and Plant Biotechnology Advances and TopicalIssues/Induced resistance: a new approach in plant protection forfloriculture and ornamental plants. Yayın Evi: Global Science Books Editör Adı: JA Teixeria da Silva
(D-10) Hakemlikler
1-) Frontiers in Microbiology. 2017. Hakemlik Sayısı: 2
2-) Frontiers in Plant Science. 2017. Hakemlik Sayısı: 3
3-) Biocontrol Science & Technology . 2015. Hakemlik Sayısı:
4-) Plant Pathology . 2015. Hakemlik Sayısı:
5-) Plant Disease (APS) . 2015. Hakemlik Sayısı:
6-) Journal of Proteome Research (ACS). 2014. Hakemlik Sayısı:
7-) National Academy Science Letters. 2014. Hakemlik Sayısı:
8-) Journal of Phytopathology . 2013. Hakemlik Sayısı:
9-) Proteome Science. 2013. Hakemlik Sayısı:
10-) Turkish Journal of Biology TUBITAK. 2013. Hakemlik Sayısı:
11-) European Journal of Plant Pathology. 2013. Hakemlik Sayısı:
12-) PLoS ONE. 2013. Hakemlik Sayısı:
13-) Physiological and Molecular Plant Pathology. 2013. Hakemlik Sayısı:
14-) Crop Protection. 2013. Hakemlik Sayısı:
15-) World Journal of Microbiology and Biotechnology. 2013. Hakemlik Sayısı:
16-) Scientia Horticulturae. 2013. Hakemlik Sayısı:
17-) European Journal of Soil Biology. 2013. Hakemlik Sayısı:
18-) Acta Physiologia Plantarum. 2013. Hakemlik Sayısı:
19-) Phytopathologia Mediterrenean. 2013. Hakemlik Sayısı:
20-) Current Microbiology. 2010. Hakemlik Sayısı:
21-) Journal of Plant Physiology. 2010. Hakemlik Sayısı:
22-) International Journal of Plant Production. 2010. Hakemlik Sayısı:
23-) Research Journal of Biological Sciences. 2009. Hakemlik Sayısı:
24-) World of Agricultural Sciences Journal. 2009. Hakemlik Sayısı:
(D-11) Hakemlikler
1-) Turkish Journal of Phytopathology. 2017. Hakemlik Sayısı: 1
2-) Alatarım. 2017. Hakemlik Sayısı: 1
(D-2) Editörlükler
1-) Editörlük Türü: Dergi. 2020. Derim.
(D-5) Editörlükler
1-) Editörlük Türü: Dergi. 2018. Asian Journal of Biological Sciences.
2-) Editörlük Türü: Dergi. 2017. DERİM.
3-) Editörlük Türü: Dergi. 2017. American Journal of Plant Physiology.
4-) Editörlük Türü: Dergi. 2017. DERİM.
5-) Current Research Journal of Biological Sciences - 2013
6-) Turkish Journal of Agriculture and Forestry (TUBITAK) - 2013
7-) Asian Journal of Plant Pathology - 2011
8-) Asian Journal of Agricultural Sciences - 2011
9-) Eurasian Network for Scientific Information - 2011
(D-6) Editörlükler
1-) Derim Dergisi (Moleküler bitki patolojisi alanında konu editörlüğü) - 2014
2-) Journal of Bacteriology Research - 2012
3-) Journal of Agricultural Biotechnology and Sustainable Production - 2012
4-) Journal of Microbiology and Antimicrobials - 2012
5-) Global Journal of Molecular Sciences - 2009
(E-1)
1-) A proteomic approach provides new insights into the control of soil-borne plant pathogens by Bacillus species. - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 6
2-) An inhibitory effect of a new Bacillus subtilis strain (EU07) against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici. - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 4
3-) Induction of disease resistance by the plant activator, acibenzolar-S-methyl (ASM), against bacterial canker (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato seedlings - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
4-) Chemical composition and antifungal activity of the essential oil of Artemisia annua L. against foliar and soil-borne fungal pathogens - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
5-) First Report of Bacterial Blight of Pomegranate Caused by Xanthomonas axonopodis pv. punicae in Turkey. - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
6-) Induction of defense-related enzymes and resistance by the plant activator acibenzolar-S-methyl in tomato seedlings against bacterial canker caused by Clavibacter michiganensis ssp.michiganensis - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 2
7-) Induction of oxidants in tomato leaves treated with DL-ß- Amino butyric acid (BABA) and infected with Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
8-) Characterization of bacterial knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi on pomegranate (Punica granatum L.) trees: a new host of the pathogen. - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
9-) A novel multiplex PCR tool for simultaneous detection of three root-knot nematodes - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 2
10-) A novel multiplex PCR tool for simultaneous detection of three root-knot nematodes - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
11-) Acibenzolar-S-methyl Induce Resistance in Pepper Leaves against Phytophthora capsici (Leonian) - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 2
12-) Molecular Characterization of Fusarium oxysporum f. melongenae virulence by ISSR and RAPD Markers on Eggplant. - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 2
13-) Characterization of Pseudoperonospora cubensis isolates from Europe and Asia using ISSR and SRAP molecular markers. - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
14-) The role of environmental factors and genetic diversity on colonization success of a non-native fish, Lepomis gibbosus from western part of Turkey. - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
15-) Characterization of Botyritis Cinerea isolates collected on pepper in Suthern Turkey by using molecular markers, fungucide resistance genes and virulence assay - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
16-) Extract of Hedera helix induces resistance on apple rootstock M26 similar to Acibenzolar-S-methyl against Fire Blight (Erwinia amylovora) - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 2
17-) The effect of a seed coating with Origanum vulgare essential oil on Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
18-) Molecular dynamics analysis of N-acetyl-D-glucosamine against specific SARS-CoV-2's pathogenicity factors - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 4
19-) Comparison of Antifungal Activity of Bacillus Strains against Fusarium graminearum In Vitro and In Planta - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 2
20-) Adjuvant composite cold atmospheric plasma therapy increases antitumoral effect of doxorubicin hydrochloride - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
21-) A proteomic approach provides new insights into the control of soil-borne plant pathogens by Bacillus species. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 5
22-) Induction of disease resistance by the plant activator, acibenzolar-S-methyl (ASM), against bacterial canker (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato seedlings - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 2
23-) An inhibitory effect of a new Bacillus subtilis strain (EU07) against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 5
24-) Chemical composition and antifungal activity of the essential oil of Artemisia annua L. against foliar and soil-borne fungal pathogens - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
25-) Induction of defense-related enzymes and resistance by the plant activator acibenzolar-S-methyl in tomato seedlings against bacterial canker caused by Clavibacter michiganensis ssp.michiganensis - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 8
26-) Characterization of bacterial knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi on pomegranate (Punica granatum L.) trees: a new host of the pathogen. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
27-) First Report of Bacterial Blight of Pomegranate Caused by Xanthomonas axonopodis pv. punicae in Turkey. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 3
28-) A novel multiplex PCR tool for simultaneous detection of three root-knot nematodes - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
29-) Characterization of Pseudoperonospora cubensis isolates from Europe and Asia using ISSR and SRAP molecular markers. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
30-) Induction of oxidants in tomato leaves treated with DL-ß- Amino butyric acid (BABA) and infected with Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 4
31-) Acibenzolar-S-methyl Induce Resistance in Pepper Leaves against Phytophthora capsici (Leonian) - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
32-) Characterization of Botyritis Cinerea isolates collected on pepper in Suthern Turkey by using molecular markers, fungucide resistance genes and virulence assay - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 2
33-) Enhanced systemic resistance to bacterial speck disease caused by Pseudomonas syringae pv. tomato by dl-ß-aminobutyric acid under salt stress - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
34-) Genetic uniformity of a specific region in SARS-CoV-2 genome and repurposing of N-acetyl-D- glucosamine - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
35-) Molecular Characterization of Fusarium oxysporum f. melongenae virulence by ISSR and RAPD Markers on Eggplant. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 3
36-) Molecular dynamics analysis of N-acetyl-D-glucosamine against specific SARS-CoV-2's pathogenicity factors - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
37-) Molecular markers reflect differentiation of Fusarium oxysporum forma speciales on tomato and forma on eggplant. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
38-) The effect of a seed coating with Origanum vulgare essential oil on Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 2
39-) The role of environmental factors and genetic diversity on colonization success of a non-native fish, Lepomis gibbosus from western part of Turkey. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 2
40-) Induction of resistance to Meloidogyne incognita by DL-Beta amino butyric acid under salt stress condition - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
41-) Induction of disease resistance and antioxidant enzymes by acibenzolar-S-methyl against bacterial wilt disease (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
42-) Induction of disease resistance by the plant activator, acibenzolar-S-methyl (ASM), against bacterial canker (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato seedlings - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 4
43-) Chemical composition and antifungal activity of the essential oil of Artemisia annua L. against foliar and soil-borne fungal pathogens - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 2
44-) A proteomic approach provides new insights into the control of soil-borne plant pathogens by Bacillus species. - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 14
45-) An inhibitory effect of a new Bacillus subtilis strain (EU07) against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici. - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 4
46-) Induction of defense-related enzymes and resistance by the plant activator acibenzolar-S-methyl in tomato seedlings against bacterial canker caused by Clavibacter michiganensis ssp.michiganensis - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 4
47-) Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici races and their genetic discrimination by molecular markers in West Mediterranean region of Turkey. - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 3
48-) Characterization of bacterial knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi on pomegranate (Punica granatum L.) trees: a new host of the pathogen. - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1
49-) A novel multiplex PCR tool for simultaneous detection of three root-knot nematodes - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 2
50-) Extract of Hedera helix induces resistance on apple rootstock M26 similar to Acibenzolar-S-methyl against Fire Blight (Erwinia amylovora) - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1
51-) Acibenzolar-S-methyl Induce Resistance in Pepper Leaves against Phytophthora capsici (Leonian) - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 2
52-) Characterization of Pseudoperonospora cubensis isolates from Europe and Asia using ISSR and SRAP molecular markers. - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 2
53-) First Report of Bacterial Blight of Pomegranate Caused by Xanthomonas axonopodis pv. punicae in Turkey. - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 3
54-) Smart Biologics For Crop Protection in Agricultural Systems. - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1
55-) The role of environmental factors and genetic diversity on colonization success of a non-native fish, Lepomis gibbosus from western part of Turkey. - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1
56-) Molecular Characterization of Fusarium oxysporum f. melongenae virulence by ISSR and RAPD Markers on Eggplant. - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1
57-) Induction of disease resistance and antioxidant enzymes by acibenzolar-S-methyl against bacterial wilt disease (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
58-) Induction of disease resistance by the plant activator, acibenzolar-S-methyl (ASM), against bacterial canker (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato seedlings - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 7
59-) Extract of Hedera helix induces resistance on apple rootstock M26 similar to Acibenzolar-S-methyl against Fire Blight (Erwinia amylovora) - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
60-) Induction of oxidants in tomato leaves treated with DL-ß- Amino butyric acid (BABA) and infected with Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
61-) Acibenzolar-S-methyl Induce Resistance in Pepper Leaves against Phytophthora capsici (Leonian) - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
62-) Induction of defense-related enzymes and resistance by the plant activator acibenzolar-S-methyl in tomato seedlings against bacterial canker caused by Clavibacter michiganensis ssp.michiganensis - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 3
63-) Chemical composition and antifungal activity of the essential oil of Artemisia annua L. against foliar and soil-borne fungal pathogens - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 5
64-) An inhibitory effect of a new Bacillus subtilis strain (EU07) against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 4
65-) Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici races and their genetic discrimination by molecular markers in West Mediterranean region of Turkey. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 3
66-) Clavibacter michiganensis subsp. michiganesis: Tracking Strains Using Their Genetic Differentiations by ISSR Markers in Southern Turkey . - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
67-) A proteomic approach provides new insights into the control of soil-borne plant pathogens by Bacillus species. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 6
68-) Ectodermal dysplasia-skin fragility syndrome with a new mutation - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 2
69-) Characterization of Pseudoperonospora cubensis isolates from Europe and Asia using ISSR and SRAP molecular markers. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
70-) Characterization of bacterial knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi on pomegranate (Punica granatum L.) trees: a new host of the pathogen. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 3
71-) First Report of Bacterial Blight of Pomegranate Caused by Xanthomonas axonopodis pv. punicae in Turkey. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
72-) The role of environmental factors and genetic diversity on colonization success of a non-native fish, Lepomis gibbosus from western part of Turkey. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
73-) A novel multiplex PCR tool for simultaneous detection of three root-knot nematodes - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 2
74-) Characterization of Botyritis Cinerea isolates collected on pepper in Suthern Turkey by using molecular markers, fungucide resistance genes and virulence assay - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
75-) Antibacterial activities of essential oils from medicinal plants against the growth of Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
76-) Laux, P., Baysal, Ö. and Zeller, W. (2002). Biological control of Fire blight by using Rahnella aquatilis Ra39 and Pseudomonas spec. Acta Hort. (ISHS) 590:225-230 - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 3
77-) Baysal, Ö., Laux, P. and Zeller, W. (2002). Further Studies on induce resistance (IR) effect of plant extract from Hedera helix against Fire Blight (E. amylovora). Acta Hort. (ISHS) 590: 273-277 - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
78-) Smart Biologics For Crop Protection in Agricultural Systems. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
79-) Induction of disease resistance and antioxidant enzymes by acibenzolar-S-methyl against bacterial wilt disease (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato. - Atıf Yılı: -1 Atıf Sayısı: 1
(E-2)
1-) Bazı ticari sabit ve uçucu yağların domates bakteriyel kanser ve solgunluk etmeni üzerine antibakteriyel etkileri. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
(E-3)
1-) An inhibitory effect of a new Bacillus subtilis strain (EU07) against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
(E-4)
1-) Chemical composition and antifungal activity of the essential oil of Artemisia annua L. against foliar and soil-borne fungal pathogens - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
(E-6)
1-) Chemical composition and antifungal activity of the essential oil of Artemisia annua L. against foliar and soil-borne fungal pathogens - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
2-) An inhibitory effect of a new Bacillus subtilis strain (EU07) against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
3-) Induction of disease resistance and antioxidant enzymes by acibenzolar-S-methyl against bacterial wilt disease (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
4-) A proteomic approach provides new insights into the control of soil-borne plant pathogens by Bacillus species. - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1
(F-1) Administered PhD/B.S./B.A. Dissertations.
1-) Tez Adı: Primer Sjogren sendromlu hastaların mononükleer hücrelerinde ve deneysel Sjögren sendromu modelinde oleuropeinin mononükleer inflamatuar hücre yanıtlarınin araştırılması. Konu: Drug discovery. Dilek-Çoban Kahraman. 2024
2-) Tez Adı: Data Mining Studies On The Whole Genome Sequence Data Of Bacillus velezensis (EU07) In Purpose Of dsRNA Silence Against Phytophthora infestans. Konu: Data Mining, on whole genome mapping.. Esra-Demiral. 2024
3-) Tez Adı: Tüm genom sekansından mikrosatellit dizilere özel primerler kullanılarak kesim haritası oluşturulmasıyla Xanthomonad' ların tür içi ayrımı . Konu: Molecular markers, molecular bacteriology. Abdul-Baasit. 2023
4-) Tez Adı: Güncel viral enfeksiyonlara karşı antiviral ilaç keşfi için moleküler kenetleme çalışmaları . Konu: Molecular docking and drug discovery . Sevim-Karakaş. 2023
5-) Tez Adı: Yeni bir Serratia fonticola (EBS19) izolatının karekterizasyonu ve Botrytis cinerea' ya karşı biyolojik kontrol ajanı olarak kullanabilme potansiyelinin araştırılması . Konu: Serratia fonticola (EBS19) izolatının genom boyutunda karekterizasyonu ve Botrytis cinerea' ya karşı biyolojik kontrol ajanı olarak kullanabilme potansiyelinin araştırılması . Efe Berk -Bozkurt. 2022
6-) Tez Adı: Biyodegredasyon ve pestisit etkinliği üzerine sinerjistik etki yaratabilen mikroorganizmaların tespiti ve ve moleküler karekterizasyonu . Konu: Biyodegredasyon ve pestisit etkinliği üzerine sinerjistik etki yaratabilen mikroorganizmaların genomsal boyutta gen haritalaması ile tespiti ve ve moleküler karekterizasyonu ve bakterilerin ürettiği proteinleri kimyasallarla etkileşiminin moleküler düzeyde incelenmesi . Gülperi -Kayran. 2022
7-) Tez Adı: Bacillus amyloliquefasiensis türüne ait EU07 izolatının (NCBI ACCESSION: PRJNA743875 ID: 743875) toprak mikrobiyomuyla etkileşiminin metagenomik haritalanması ve ICP analizlerinin biyoinformatik açıdan değerlendirilmesi . Konu: Toprak mikrobiyomunun metagenomik analizlerle haritalanması ve ICP analizlerinin biyoinformatik açıdan değerlendirilmesi . Yiğit -Kürüm. 2022
8-) Tez Adı: Serratia marcescens GBS19 İzolatına Ait Kitinaz A Gen Bölgesinin Klonlanması, Ekspresyonu, Saflaştırılması ve Tarım Zararlısı Myzus persicae Üzerine İnsektisidal Akitivitesinin İncelenmesi. Konu: Serratia marcescens GBS19 İzolatına Ait Kitinaz A Gen Bölgesinin Klonlanması, Ekspresyonu, Saflaştırılması ve Tarım Zararlısı Myzus persicae Üzerine İnsektisidal Akitivitesinin İncelenmesi. Ahmet-Can. 2022
9-) Tez Adı: Bazı uçucu yağların domates bakteriyel kanser ve solgunluk (Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) etmeninin kontrolündeki etkinliğinin belirlenmesi ve bu yağların film kaplamada kullanımı. Konu: Moleküler Bakteriyoloji. Meral -Yılmaz. 2014
10-) BAZI UÇUCU YAĞLARIN DOMATES BAKTERİYEL KANSER ve SOLGUNLUK (Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) ETMENİNİN KONTROLÜNDEKİ ETKİNLİĞİNİN BELİRLENMESİ ve BU YAĞLARIN FİLM KAPLAMADA KULLANIMI. - 2013
(F-2) Administered graduate dissertations
1-) Tez Adı: EU07 İzolatının Turunçgil Kahverengi Çürüklük ve Gövde Zamklanması Hastalığı Etmeni Phytophthora citrophthora'ya Karşı Antagonistik Etkinliği ve Etki Mekanizmalarının Moleküler Karakterizasyonu. Konu: EU07 İzolatının Turunçgil Kahverengi Çürüklük ve Gövde Zamklanması Hastalığı Etmeni Phytophthora citrophthora'ya Karşı Antagonistik Etkinliği ve Etki Mekanizmalarının Moleküler Karakterizasyonu. Ahmet-Korkut. 2022
2-) Tez Adı: Bakteriyel kanser teşhisine yönelik hızlı tanı kiti tasarlanması . Konu: Moleküler Bakteriyoloji. Burak -Şener. 2020
3-) Tez Adı: Understanding neurodegeneration: Pathway analysis of neurodegenerative disorders by merged and meta-analyzed gene expression data. Konu: Biyoinformatik . Abdulahad-Bayraktar. 2019
(G-1) Principle Researcher in projects supported by international institutions
1-) 1. BMF ve Novartis ortaklığı ile araştırma projesi. Hedera helix bitki ekstraktı ve Acibenzolar-S-methyl ‘in Ateş yanıklığı hastalığına karşı dayanıklılık uyarıcı etkisi ve etki mekanizmasının araştırılması. Almanya Biyolojik Araştırmalar Enstitüsü (BBA) - 2001
(G-2) Being part of a project supported by international institutions (researcher, trainer, advisor, etc.)
1-) Birleşmiş Milletler UNIDO MeBr sonlandırma Projesi bölge sorumlusu ve proje eğitimcisi - 2007
2-) Almanya, Mısır ortak DFG projesi. Rahnella aquantalis adlı bir antagonist bakterinin ateşyanıklığı hastalığına karşı kullanım etkinliğinin araştırılması Proje süresi: 1999-2001 - 2001
(G-3-Eski) Principle Researcher in projects supported by TÜBİTAK, TÜBA, DPT, KOSGEB, Ministries and other similar public or private institutions.
1-) Batı Akdeniz Bölgesi sera alanlarında Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici nin virulent ırkları ile Fusarium oxysporum f.sp. radicis lycopersici nin yaygınlığının moleküler karakterizasyonu. - 2012
2-) Bazı yağ asitlerinin bitki bakteriyel hastalıklarını engelleyici etkilerinin araştırılması - 2006
(G-4)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: Moleküler Mikrobiyoloji ve Genetik . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. TUBITAK COST PROJESİ 2515 No. 1130882 Örtüaltı Biber Yetiştiriciliğinde Görülen Kurşuni Küf Hastalığı (Botrytis cinerea) İzolatlarının Fungisitlere Karşı Direnç Durumunun ve Genetik Farklılıklarının Moleküler Yöntemlerle Tanımlanması, BATEM Gen Havuzunda Bulunan Islah Materyallerinin Reaksiyonlarının Belirlenmesi. 2014-2016
(G-4-Eski) Being part of a project supported by TÜBİTAK, TÜBA, DPT, KOSGEB, Ministries and other similar public or private institutions (researcher, trainer, advisor, etc.) TÜBİTAK, TÜBA, DPT, KOSGEB,)
1-) Yalancı mildyöde genetik ayırımın bazı markör genler yardımıyla belirlenmesi - 2013
2-) CNR Genetik Enstitüsü ile bakteriyel ve fungal patojenlerin genetik ayırımı konusunda işbirliği ortak çalışma programı EU ortaklığı(2006-2012) - 2012
3-) Türkiye F1 Hibrit Sebze Çeşitlerinin Geliştirilmesi ve Tohumluk Üretiminde Kamu-Özel Sektör İşbirliği Projesi. - 2009
4-) Biberde (Capsicum annuum L.) Kök Boğazı Yanıklığı (Phytophthora capsici) ve Patlıcanda (Solanum melongena) Fusarium Solgunluğu’na (Fusarium oxysporum f.sp. melongenae) Dayanıklılığı Kontrol eden Genlerin Haritalanması ve Moleküler Markırların Oluşturulması - 2009
5-) Yaş sebze ihracatında sorun olan fungal ve bakteriyel hastalıklara karşı pestisitlere alternatif mücadele yollarının araştırılması . - 2008
6-) 8. Domateste Sistemik kazanılmış Dayanıklılığın (SAR) ß-DL-Aminobütirik asit (BABA), ve Biyolojik Kontrol Ajanından Üretilmiş Bir Preperat (Serenade) ile Sağlanması ve Bunların Etkileri Üzerine Araştırmalar. - 2007
7-) Domateste Sistemik kazanılmış Dayanıklılığın (SAR) ß-DL-Aminobütirik asit (BABA), ve Biyolojik Kontrol Ajanından Üretilmiş Bir Preperat (Serenade) ile Sağlanması ve Bunların Etkileri Üzerine Araştırmalar. - 2007
8-) Türkiye’de fasulye de hastalık yapan bakteriyel etmen Pseudomonas syringae pv. phaseolicola izolatlarının farklılığının tespiti. - 2007
9-) DPT Projesi Yardimci Arastirmaci - 2004
(G-5)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: Biyoinformatik, veri madenciliği, makine öğrenme, suni zeka. Proje Türü: -Tübitak 1002. Yeni Antibakteriyel AjanlarınTanımlanması Için Makine Öğrenmeye Dayalı Biyoinformatik Çerçevesi Geliştirmek. 2022-2023
(G-7)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: Metagenomics. Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Bacillus subtilis var.amyloliquefaciens türüne ait EU07 izolatının toprak mikrobiyomu ve mikroflorayla etkileşiminin metagenomik haritalanması ve ICP analizlerinin bioinformatik açıdan değerlendirilmesi. 2021-2022
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: Moleküler Bakteriyoloji ve Genetik . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Xanthomonas genusuna ait domates ve biberde bakteriyel hastalık etmenlerinin çok yönlü sekans dizilimine ve. 2013-2016
3-) Xanthomonas genusuna ait bakteriyel patojenlerin moleküler marker ve MLST ile ayrımları (BAP projesi, Muğla Üniversitesi - 2013
(Ğ-2) National scientific awards in related field
1-) Kurum Adı: . Poster ödülü 2.. 2018
2-) Kurum Adı: . Qiagen Turkiye tarafindan basari belgesi. 2014
3-) Kurum Adı: . TUBITAK Bilimsel yayımları teşvik ödülü. 2008
4-) TUBITAK - 2007
5-) TUBITAK - 2005
6-) TUBITAK - 2005
7-) TUBITAK - 2005
8-) TUBITAK - 2003
(H-2)
1-) Patent Sahibi: Ragip Soner Silme, Said Nadeem, Ömür Baysal . Sınavda hile yapmayı önleyen masa. 2021
2-) Patent Sahibi: Meral YILMAZ, Ömür Baysal, R. Soner Silme. Tohum kaplama teknolojisi. 2020
(I-10)
1-) Invited researcher and speaker by Belarus National Academy Science of Belarus/ Institute of Genetics and Cytology. Belarus. . 2023
(I-20)
1-) RNAseq analysis DEseq2. US. . 2024
2-) NAMD Log Analysis. US. . 2024
3-) New genome sequencing and annotation NCBI database submission . US. . 2023
4-) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_JAIFZJ000000000.1 /https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/GCF_019997305.1/. Amerika. . 2022