1-) Akgüç Çöl Nihan, Özyiğit İbrahim İlker, Yarcı Celal, 2021. Pyracantha coccinea Roem. (Rosaceae) As a Biomonitor for Cd, Pb and Zn in Mugla Province (Turkey). Pakistan Journal of Botany

2-) Akgüç Çöl Nihan, Özyiğit İbrahim İlker, Leblebici Zeliha, Yarcı Celal, 2010. Use of Pyracantha coccinea Roem. as a possible biomonitor for the selected heavy metals. International Journal of Environmental Science & Technology

1-) Dibek Esra, Sezer Merve, Akgüç Çöl Nihan, Çöl Bekir, 2021. Genomic Library Construction of a Boron Tolerant Bacterium in Escherichia coli and Selection by Boron. Turkish Journal of Molecular Biology & Biotechnology,

1-) Akgüç Çöl Nihan, 2019. Peptit Nükleik Asitler (PNA) ve Veteriner Hekimliği Alanındaki Uygulamaları. International Journal of Innovative Approaches in Science Research

1-) Dibek Esra, Babayeva Anara, Sezer Merve, Akgüç Çöl Nihan, Çöl Bekir, 2020. Bor içeren bazı antibiyotikler. Journal of Boron

1-) Çöl Bekir, Kasap Murat, Akpınar Gürler, Akgüç Çöl Nihan, Tanrıseven Aslı, 2011. 2D Gel Electrophoresis of The Cytoplasmic Protein Extracts of a Highly Boron Tolerant Pseudomonas Strain, Newly Isolated from a Boron Mine.. The International Congress on Bioinformatics and Biomics

2-) İğci Naşit, Özel Demiralp Fatma Duygu, Ayhan Beycan, Akgüç Çöl Nihan, Çöl Bekir, 2011. Preliminary Proteomic Analysis of Bacillus boroniphilus and analysis of a protein spot by MALDI TOF Mass Spectrometry. The international Congress on Bioinformatics and Biomics

3-) Çöl Bekir, Akgüç Çöl Nihan, Şahin Nurettin, Güneş Hatice, Arslantürk Ahmet, 2010. Isolation and Characterization of Boron Tolerant Bacteria from The Biggest Boron Mine Kırka TURKEY in The World.. American Society for Microbiology (ASM) Congress

4-) Şahin Nurettin, Akgüç Çöl Nihan, Tanrıseven Aslı, Arslantürk Ahmet, Güneş Hatice, Çöl Bekir, 2009. Balıkesir Bor Madenlerinden Bor Toleransı Yüksek Bakterilerin İzolasyonu ve Fenotipik Karakterizasyonu. 4. Uluslararası Bor Sempozyumu

5-) Çöl Bekir, Akgüç Çöl Nihan, Güneş Hatice, Karakaya Ramazan, Şahin Nurettin, Arslantürk Ahmet, 2009. Bor Toleransı Yüksek Bazı Bakterilerin Bazı Enzim İçeriklerinin Tespiti.. 4. Uluslararası Bor Sempozyumu

6-) Akgüç Çöl Nihan, Yözdemir Didem, Arslantürk Ahmet, Şahin Nurettin, Güneş Hatice, Çöl Bekir, 2009. Bazı Bakterilerin Bor Konsantrasyonuna Bağlı Büyüme Hızlarının Belirlenmesi.. 4. Uluslararası Bor Sempozyumu

7-) Akgüç Çöl Nihan, Rao Jayasimha, Rajagopalan Govindarajan, Sriranganathan Nammalwar, 2021. Peptide Nucleic Acids for the Prevention/Treatment of Persistent Infections Caused by Staphylococcus aureus Biofilms. VCOM Research Recognition Day

8-) Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Akgüç Çöl Nihan, 2018. Identification of a gene that may be involved in providing boron tolerance to an extremophilic Bacillus isolate. The 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity

9-) Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Akgüç Çöl Nihan, 2018. Identification and analysis of mRNA levels of an antiporter, excinuclease subunit and endonuclease genes in response to boron in a Pseudomonas isolate. Annual Conference 2018 of the Association for General and Applied Microbiology

10-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Akgüç Çöl Nihan, 2017. Investigation of boron-related genes in a highly boron tolerant isolate similar to Pseudomonas zhaodongensis. International Congress on Molecular Biology and Biotechnology

1-) Çöl Bekir, Kasap Murat, Akpınar Gürler, Akgüç Çöl Nihan, Tanrıseven Aslı, 2011. 2D Gel Electrophoresis of The Cytoplasmic Protein Extracts of a Highly Boron Tolerant Pseudomonas Strain, Newly Isolated from a Boron Mine.. The International Congress on Bioinformatics and Biomics

2-) İğci Naşit, Özel Demiralp Fatma Duygu, Ayhan Beycan, Akgüç Çöl Nihan, Çöl Bekir, 2011. Preliminary Proteomic Analysis of Bacillus boroniphilus and analysis of a protein spot by MALDI TOF Mass Spectrometry. The international Congress on Bioinformatics and Biomics

3-) Çöl Bekir, Akgüç Çöl Nihan, Şahin Nurettin, Güneş Hatice, Arslantürk Ahmet, 2010. Isolation and Characterization of Boron Tolerant Bacteria from The Biggest Boron Mine Kırka TURKEY in The World.. American Society for Microbiology (ASM) Congress

4-) Şahin Nurettin, Akgüç Çöl Nihan, Tanrıseven Aslı, Arslantürk Ahmet, Güneş Hatice, Çöl Bekir, 2009. Balıkesir Bor Madenlerinden Bor Toleransı Yüksek Bakterilerin İzolasyonu ve Fenotipik Karakterizasyonu. 4. Uluslararası Bor Sempozyumu

5-) Çöl Bekir, Akgüç Çöl Nihan, Güneş Hatice, Karakaya Ramazan, Şahin Nurettin, Arslantürk Ahmet, 2009. Bor Toleransı Yüksek Bazı Bakterilerin Bazı Enzim İçeriklerinin Tespiti.. 4. Uluslararası Bor Sempozyumu

6-) Akgüç Çöl Nihan, Yözdemir Didem, Arslantürk Ahmet, Şahin Nurettin, Güneş Hatice, Çöl Bekir, 2009. Bazı Bakterilerin Bor Konsantrasyonuna Bağlı Büyüme Hızlarının Belirlenmesi.. 4. Uluslararası Bor Sempozyumu

7-) Akgüç Çöl Nihan, Rao Jayasimha, Rajagopalan Govindarajan, Sriranganathan Nammalwar, 2021. Peptide Nucleic Acids for the Prevention/Treatment of Persistent Infections Caused by Staphylococcus aureus Biofilms. VCOM Research Recognition Day

8-) Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Akgüç Çöl Nihan, 2018. Identification of a gene that may be involved in providing boron tolerance to an extremophilic Bacillus isolate. The 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity

9-) Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Akgüç Çöl Nihan, 2018. Identification and analysis of mRNA levels of an antiporter, excinuclease subunit and endonuclease genes in response to boron in a Pseudomonas isolate. Annual Conference 2018 of the Association for General and Applied Microbiology

10-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Akgüç Çöl Nihan, 2017. Investigation of boron-related genes in a highly boron tolerant isolate similar to Pseudomonas zhaodongensis. International Congress on Molecular Biology and Biotechnology

1-) Çöl Bekir, Akgüç Çöl Nihan, Karakaya Ramazan, Tanrıseven Aslı, Güneş Hatice, 2010. Eskişehir Kırka Bor Madeni ve Çevresinden Elde Edilen Toprak Maden ve Su Örneklerindeki Bor Miktarlarının Azomethin H Yöntemi ile Tespit Edilmesi. 20. Ulusal Biyoloji Kongresi

1-) Karakaya Ramazan, Dibek Esra, Akgüç Çöl Nihan, Çöl Bekir, 2012. Bakterilerde Hücresel Bor Miktarının Belirlenmesi için Azomethin H Yönteminin Kullanılması. 21. Ulusal Biyoloji Kongresi

2-) Akgüç Çöl Nihan, Şahin Nurettin, Arslantürk Ahmet, Güneş Hatice, Çöl Bekir, 2010. Bor İçeriği Yüksek Ortamlardan İzole Edilen Zhihengliuella Halotolerans Türüne Ait İzolatların Bazı Fizyolojik ve Fenotipik Özelliklerinin Belirlenmesi.. 20. Ulusal Biyoloji Kongresi

3-) Çöl Bekir, Yözdemir Didem, Akgüç Çöl Nihan, Arslantürk Ahmet, Şahin Nurettin, Güneş Hatice, 2010. Kütahya- Emet’teki Espey Bor Maden Yatağı ve Çevresinden Bor Toleransı Yüksek Bakterilerin İzolasyonu ve Fenotipik Karakterizasyonu. 20. Ulusal Biyoloji Kongresi

4-) Çöl Bekir, Karakaya Ramazan, Akgüç Çöl Nihan, Şahin Nurettin, Arslantürk Ahmet, Güneş Hatice, 2010. Bazı Mikroorganizmaların Bor Toleranslarının Belirlenmesi.. 20. Ulusal Biyoloji Kongresi

5-) Çöl Bekir, Şahin Nurettin, Yözdemir Didem, Akgüç Çöl Nihan, Arslantürk Ahmet, Güneş Hatice, 2008. Eskişehir-Kırka Bor Maden Yatakları ve Çevresinden Bor Toleransı Yüksek Bakterilerin İzolasyonu. XXXIII. Türk Mikrobiyoloji Kongresi

1-) Use of Pyracantha coccinea Roem. as a possible biomonitor for the selected heavy metals - Atıf Yılı: -1 Atıf Sayısı: 28

2-) Pyracantha coccinea Roem. (Rosaceae) As a Biomonitor for Cd, Pb and Zn in Mugla Province (Turkey) - Atıf Yılı: -1 Atıf Sayısı: 30

1-) Use of Pyracantha coccinea Roem. as a possible biomonitor for the selected heavy metals - Atıf Yılı: -1 Atıf Sayısı: 5

2-) Pyracantha coccinea Roem. (Rosaceae) As a Biomonitor for Cd, Pb and Zn in Mugla Province (Turkey) - Atıf Yılı: -1 Atıf Sayısı: 11

1-) Pyracantha coccinea Roem. (Rosaceae) As a Biomonitor for Cd, Pb and Zn in Mugla Province (Turkey) - Atıf Yılı: -1 Atıf Sayısı: 2

2-) Use of Pyracantha coccinea Roem. as a possible biomonitor for the selected heavy metals - Atıf Yılı: -1 Atıf Sayısı: 6

1-) Use of Pyracantha coccinea Roem. as a possible biomonitor for the selected heavy metals - Atıf Yılı: -1 Atıf Sayısı: 1

2-) Pyracantha coccinea Roem. (Rosaceae) As a Biomonitor for Cd, Pb and Zn in Mugla Province (Turkey) - Atıf Yılı: -1 Atıf Sayısı: 1

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Endemik Leopoldia buseana'nın İn Vitro Antikanser ve Antioksidan Aktivitelerinin Araştırılması. 2024-2025

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Deniz kültür balıklarından izole edilen Photobacterium damselae subsp. piscicida suşlarının virülans gen profillerinin karakterizasyonu ve antimikrobiyal direnç özelliklerinin belirlenmesi. 2021-2022

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Danışman. Konu: Antibiyotiklere dirençli Staphylococcus aureus suşları, birçok hastalığın tedavisinde ve iyileştirilmesinde antibiyotiklerin aşırı kullanımı nedeniyle insan ve hayvan sağlığı için giderek artan bir tehdit oluşturmaktadır. Bu hastalıklardan biri olan sığır mastitisi, hayvan refahı, süt hayvancılığının ekonomik uygulanabilirliği ve süt sürülerinin genel sağlığı üzerinde önemli etkileri olan çok yönlü bir sorundur. Bu proje kapsamında, farklı süt çiftliklerindeki mastitisli ineklerin sütlerinde S.aureus olarak tanımlanan bakterilerin antibiyotik direnç genlerinin (mecA, blaZ, aacA-aphD, tetK/M, vanA, cfr, fusB ve ileS) varlığını araştırılmıştır. S. aureus'u izole etmek ve tanımlamak için Baird-Parker agar plaklarına süt inoküle edilmiştir. Her bir S. aureus izolatının moleküler tanımlaması için termonükleaz geni (nuc) kullanılmıştır. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) analizi kullanılarak, tüm izolatların (%100) tetK ve blaZ genlerini, %57,1'inin aacA-aphD genini, %21,4'ünün mecA genini ve %7,1'inin cfr genini taşıdığı tespit edilmiştir. Sonuçlarımız sütün S. aureus ile kontamine olduğunu ve neredeyse tüm izolatların çoklu ilaca dirençli (MDR) olduğunu göstermiştir. Özetle, çalışmamız, bu bölgede halk sağlığı sorunlarına neden olan bakterilerin önlenmesi ve tedavisine yardımcı olmak için süt ineklerinden alınan süt örneklerinde S. aureus'un düzenli olarak izlenmesinin faydasını vurgulamaktadır.. Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Muğla ili Milas İlçesinde Mastitisli İneklerin sütlerinden izole edilen Staphylococcus aureus izolatlarında bazı antibiyotik direnç genlerinin araştırılması. 2022-2024

2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Danışman. Konu: Sığır mastitis hastalığı çoğunlukla bakteriyel enfeksiyondan kaynaklı olarak meme bezinin iltihaplanmasıdır. Bu durum, süt hayvancılığı sektöründe ve süt endüstrisinde büyük ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Sığır mastitisinin tedavisinde, bugüne kadar yüksek oranla antibiyotikler kullanılmıştır. Fakat kontrolsüz dozda antibiyotik kullanımı ve enfeksiyoz etkene yönelik doğru antimikrobiyel seçiminin yapılmaması, patojenleri içeren konakçı mikrobiyotasında bir veya birden fazla antibiyotiğe karşı direncin ortaya çıkmasına neden olmuştur. Bu nedenle bakterilerin antibiyotiklere karşı gelişen antimikrobiyal direnç şablonlarının belirlenmesi, izlenmesi ve asıl soruna cevaben alternatif etkili tedavilerin ortaya konulması gerekmektedir. Bu amaçla, güvenli olarak tanınan, engelleyici özellikleri nedeniyle laktik asit bakterileri (LAB), çeşitli inflamatuar durumların ve hastalıkların önlenmesinde ve tedavisinde giderek daha popüler hale gelmektedir. LAB, insan sağlığı üzerindeki yararlı etkileri nedeniyle uzun yıllardır araştırılmaktadır. Probiyotiklerin insan mastitisinin tedavisi için antibiyotik etkili bir alternatif olduğu gösterilmiştir. Aynı şekilde, probiyotiklerin kullanımı veteriner camiasında da ilgi görmüştür. Laktik asit bakterilerinin, güçlü immünomodülatör aktiviteleri nedeniyle yem takviyesi, meme ucuna daldırma ve meme içi aşılama olarak kullanıldıklarında mastitise karşı koruma sağlayabildikleri tespit edilmiştir. Laktik asit bakterilerinin memeyi kolonize ederek, mastitise neden olan patojenlerin gelişimini engelleyen koruyucu bir biyofilm oluşturduğu ve bu yolla mastiti önlediği görülmüştür. Proje kapsamında, Muğla ilinde laktasyon dönemindeki sağlıklı ineklerden alınan sütlerden potansiyel probiyotik organizmaların izole edilerek, saha mastitis olgularından izole edilen bazı patojenlere karşı antimikrobiyal özelliklerinin tespit edilmesi amaçlanmıştır.. Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Laktasyon Dönemindeki Sağlıklı İneklerden Alınan Sütlerden Laktik Asit Bakterilerinin İzolasyonu ve Saha Mastitis Olgularından İzole Edilen Bazı Patojenlere Karşı Antimikrobiyal Özelliklerinin Belirlenmesi. 2021-2023

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 3501. BOR VE BAKTERİ İLİŞKİSİNİN MOLEKÜLER, BİYOKIMYASAL VE MİKROBİYOLOJİK YAKLAŞIMLARLA ARAŞTIRILMASI. 2008-2011

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. PEPTIDE NUCLEIC ACIDS FOR THE PREVENTION OF PERSISTENT WOUND INFECTIONS CAUSED BY STAPHYLOCOCCUS AUREUS BIOFILMS . 2019-2020

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. ESKIŞEHIR-KIRKA BOR MADEN YATAKLARI VE ÇEVRESINDEN BOR TOLERANSI YÜKSEK BAKTERILERIN İZOLASYONU, MOLEKÜLER KARAKTERIZASYONU VE BOR TOLERANSI ILE İLGILI GENLERIN ARAŞTIRILMASI . 2012-2013