1-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, 2024. Genome-Wide Screens Identify Genes Responsible for Intrinsic Boric Acid Resistance in Escherichia coli. Biological Trace Element Research

2-) Elgin Emine Sonay, Çatav Şükrü Serter, Babayeva Anara, Kım Hakbeom, Dibek Esra, Çöl Bekir, Chae Young Kee, Kıvrak İbrahim, 2023. NMR metabolomics analysis of Escherichia coli cells treated with Turkish propolis water extract reveals nucleic acid metabolism as the major target. Journal of Applied Microbiology

3-) Canbek Umut, Dibek Esra, Akgün Ulaş, Çöl Bekir, Dubektas Canbek Tugba, Aydoğan Nevres Hürriyet, Usmanov Nosirzhon, Kasap Murat, Akpınar Gürler, 2021. Analysis of the fluid biochemistry in patients with prolonged wound drainage after hip hemiarthroplasty. Injury

1-) Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Akgüç Çöl Nihan, Çöl Bekir, 2017. Genomic library construction of a boron tolerant bacterium in Escherichia coli and selection by boron. Turkish Journal of Molecular Biology & Biotechnologyv

1-) Babayeva Anara, Dibek Esra, Sünnetçi Akkoyunlu Deniz, Çine Naci, Kasap Murat, Akpınar Gürler, Çöl Bekir, 2024. The effect of Epetraborole on the transcriptome and proteome of Escherichia coli strain overexpressing leuS, Leucyl-tRNA Synthetase. Frontiers in Life Sciences and Related Technologies

2-) Dibek Esra, Babayeva Anara, Sezer Merve, Akgüç Çöl Nihan, Çöl Bekir, 2020. Bor içeren bazı biyoaktif bileşikler. Journal of Boron

3-) Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Çiftçi Begüm Hazar, Çöl Bekir, 2020. P1 transdüksiyon yöntemi ile birden fazla gen bakımından mutant olan Escherichia coli suşlarının elde edilmesi. Bitlis Eren Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi

4-) Demirel Gizem Nur, Allı Hakan, Babayeva Anara, Dibek Esra, Çöl Bekir, 2019. ENTOLOMA MOUGEOTİİ (Fr.) Hesler: A NEW RECORD FOR TURKISH MYCOTA FROM KÖYCEĞİZ PROVINCE. Mugla Journal of Science and Technology

5-) Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Çöl Bekir, 2018. IMPORTANCE OF SOME METALLOIDS IN BIOLOGICAL LIFE. Mugla Journal of Science and Technology

1-) Dibek Esra, Dal Burcu, Babayeva Anara, Çöl Bekir, 2023. Escherichia coli’de sodA, sodB ve sodC genlerinin promotor bölgelerinin klonlanması ve transkripsiyonel füzyon konstruktları ile genlerin ekspresyonu üzerinde doksorubisin etkisinin araştırılması. EGE 10th INTERNATIONAL CONFERENCE ON APPLIED SCIENCE

2-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, 2023. Bor içeren Epetraborole antibiyotiğinin bazı Escherichia coli suşları üzerindeki antimikrobiyal etkisi. European Conferences 2nd International Conference on Health, Engineering And Applied Sciences

3-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, Babayeva Anara, 2023. Determination of the susceptibility profiles of the Escherichia coli delta-yfeS mutant to selected antibiotics. 5. International Scientific Research Congress

4-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, 2023. Determination of the susceptibility of Escherichia coli delta-yfeS mutant to zinc (zn), cadmium (cd) and mercury (hg) heavy metals. 5. International Scientific Research Congress

5-) Öztürkel Kabakaş Hatice, Onat Taşdelen Kadriye Aslıhan, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, 2022. Lack Of Expression Of The queE Gene In Escherichia coli Causes Sensitivity to Benzoic Acid. Ege 7th International Conference On Applied Sciences

6-) Onat Taşdelen Kadriye Aslıhan, Öztürkel Kabakaş Hatice, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, 2022. Knockout Of yhbE Gene In Escherichia coli Decreases Trans Cinnamic Acid Tolerance. Ege 7th International Conference On Applied Sciences

7-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, 2022. Epetraborole içeren ortamda rplE geninin aşırı ifadesi Escherichia coli suşuna avantaj sağlar. Anadolu 11. Uluslararası Uygulamalı Bilimler Kongresi

8-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, Babayeva Anara, 2022. Overexpression of The yjcF Gene in Escherichia coli Enhances Boric Acid Tolerance and Knockout of This Gene Decreases Tolerance. International Cappadocia Scientific Research Congress

9-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, Babayeva Anara, Kasap Murat, Akpınar Gürler, 2022. Boric Acid Stress Upregulate TnaA Protein in Escherichia coli and Increased Expression of The tnaC Gene Makes The Strain More Tolerant. International Cappadocia Scientific Research Congress

10-) Babayeva Anara, Akoyunlu Sünnetçi Deniz, Dibek Esra, Çine Naci, Çöl Bekir, 2022. Investigation of The Effect of Chloramphenicol and IPTG On Escherichia coli Transcriptome in The Presence of Recombinant Plasmid . Karabakh III. International Congress of Applied Sciences

11-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Babayeva Anara, Sezer Kürkçü Merve, 2022. D-Aminoacyl-tRNA Decylase Gene Determined as A Result of Selection of Escherichia coli Genome-Wide Library Under Boric Acid Stress by Enrichment Method. International Conference on Global Practice of Multidisciplinary Scientific Studies Dedicated to the 100th Anniversary of "Georgian Technical University - GTU

12-) Babayeva Anara, Elgin Emine Sonay, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, 2021. Türkiye’de Rize ve Artvin bölgesinden toplanan propolis örneklerinden elde edilen ekstraktların antimikrobiyal etkilerinin araştırılması. KARABAĞ 2. ULUSLARARASI UYGULAMALI BİLİMLER KONGRESİ "Zafer Günü ve Şehitlerin Anısına"

13-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, Babayeva Anara, 2021. Transposon Mutagenesis In Bacteria And Some Studies. INTERNATIONAL HALICH CONGRESS ON MULTIDISCIPLINARY SCIENTIFIC RESEARCH

14-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, Babayeva Anara, 2021. Understanding The Relationship Of Gene And Phenotype Forward And Reverse Genetic Approaches. INTERNATIONAL HALICH CONGRESS ON MULTIDISCIPLINARY SCIENTIFIC RESEARCH

15-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Elgin Emine Sonay, 2021. Bazı fenolik bileşiklerin Escherichia coli üzerindeki antimikrobiyal etkisinin araştırılması. INTERNATIONAL CAPPADOCIA SCIENTIFIC RESEARCH CONGRES

16-) Dibek Esra, Babayeva Anara, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Elgin Emine Sonay, 2021. IN VITRO STUDIES ON THE ANTIMICROBIAL EFFECT OF PROPOLIS SAMPLES COLLECTED FROM SOME REGIONS IN TURKEY. INTERNATIONAL CAPPADOCIA SCIENTIFIC RESEARCH CONGRESS

17-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Merve, 2020. DNA Mikrodizin analizi ve Escherichia coli ile yapılan bazı çalışmalar. 2nd Annual International Turkic World Congress on Science and Engineering

1-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, 2021. Artificial Higher Expression of yjbO Gene Confers Tolerance Against Epetraborole Antibiotic in Escherichia coli. II. INTERNATIONAL KARABAKH CONGRESS OF APPLIED SCIENCES

2-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Sezer Merve, Babayeva Anara, 2018. OMP Encoded Genes in Escherichia coli and the Phenotypes of the Corresponding Mutants under Several Salt, Metal and Antibiotics Stresses. The 4rd International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB2018)

3-) Çöl Bekir, Dibek Esra, Kasap Murat, Akpınar Gürler, Sezer Merve, Kapusuz Gülşah, 2018. Boric Acid Stress Induction of clpP gene in Bacillus subtilis. The 4rd International Symposium on EuroAsian Biodiversity

4-) Çöl Bekir, Dibek Esra, Kasap Murat, Akpınar Gürler, Kapusuz Gülşah, 2018. Boric Acid Stress Induction of clpP gene in Bacillus subtilisBoric Acid Stress Induction of clpP gene in Bacillus subtilis. The 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity

5-) Sezer Merve, Dibek Esra, Çöl Bekir, 2018. Potential Relationship between Galactarate/Glucarate/Glycerate Transporter GarP and Boron Toxicity in Escherichia coli. The 4rd International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB2018)

6-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Merve, 2018. Boron containing antibiotics. The 4rd International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB2018)

7-) Çöl Bekir, Babayeva Anara, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, 2018. Boron containing antibiotics. The 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity

8-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Akgüç Çöl Nihan, 2017. Investigation of boron-related genes in a highly boron tolerant isolate similar to Pseudomonas zhaodongensis. International Congress on Molecular Biology and Biotechnology

1-) Çöl Bekir, Sezer Merve, Dibek Esra, Akgüç Çöl Nihan, 2018. Identification of a Gene that may be Involved in Providing boron tolerance to an Extremophilic Bacillus Isolate. The 4rd International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB2018)

2-) Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Akgüç Çöl Nihan, 2018. Identification of a gene that may be involved in providing boron tolerance to an extremophilic Bacillus isolate. The 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity

3-) Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, 2018. yfeS mutant of Escherichia coli is comparatively hypersensitive to boric acid and may play a role in boron stress response. Annual Conference 2018 of the Association for General and Applied Microbiology

4-) Tırpan Ezgin, Dibek Esra, Allı Hakan, Çöl Bekir, 2018. The Contribution of Molecular Analyzes to Macrofungal Systematics in Turkey. The 4rd International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB2018)

5-) Tırpan Ezgin, Dibek Esra, Çöl Bekir, Allı Hakan, 2018. The Contribution of Molecular Analyzes to Macrofungal Systematics in Turkey. The 4rd International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB2018)

6-) Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Akgüç Çöl Nihan, 2018. Identification and analysis of mRNA levels of an antiporter, excinuclease subunit and endonuclease genes in response to boron in a Pseudomonas isolate. Annual Conference 2018 of the Association for General and Applied Microbiology

7-) Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, 2017. The Bacterial Toxin-Antitoxin DinJ/YafQ module and Boron Toxicity in Escherichia coli. International Congress on Molecular Biology and Biotechnology

8-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Çiftçi Begüm Hazar, 2017. The effect of boric acid stress on the mRNA levels of some genes detected initially by proteomics analysis in Escherichia coli. International Congress on Molecular Biology and Biotechnology

9-) Çöl Bekir, Demirsoy Emir, Uluçoban Niyazi X, Has Gökçe, Babayeva Anara, Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Allı Hakan, Civelek Hasan Sungur, 2017. Distinguishing the black Truffle samples purchased for commercial purposes in Turkey by molecular typing using multiplex PCR analyzes. International Congress on Molecular Biology and Biotechnology

10-) Dibek Esra, Çöl Bekir, 2016. Bazı Pseudomonas İzolatlarında Bor ile İlgili Genlerinin Araştırılması. Uluslararası Tarımda Bor Sempozyum

11-) Çöl Bekir, Çiftçi Begüm Hazar, Kasap Murat, Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Akpınar Gürler, 2015. Proteomic Profiling of Escherichia coli Cytoplasmic Proteins under Different Boron Concentrations. Gordon Research Seminars: Applied & Environmental Microbiology (GRS)

12-) Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Çiftçi Begüm Hazar, Karakaya Ramazan, 2014. Çam Balından DNA izolasyonu ve S35 promotor bölgesinin gerçek zamanlı PCR analizi: manyetik boncuk kullanımının ve iki farklı PCR yaklaşımının değerlendirilmesi. 4. Uluslararası Muğla Arıcılık ve Çam Balı Kongresi

1-) Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Çöl Bekir, 2015. Moleküler, mikrobiyolojik ve genomik yaklaşımlar kullanılarak ekstremofil Staphyloccus sp. bakterisinde Bor’a karşı aday stres geninin tespit edilmesi: homolog fosfat ABC transporter. XIV. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi

2-) Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, 2015. Bor Madeninden izole edilmiş bir Pseudomonas sp’nin genomik kütüphanesinin oluşturulması ve Bor seleksiyonu sonucu Bor toleransına karşılık gelen astADB gen grubunun belirlenmesi. XIV. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi

3-) Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, 2014. Kırka Bor Madeninden İzole Edilen bir Pseudomonas putida benzeri izolatta OmpA/MotB domain proteinin belirlenmesi ve Bor tolerans aday geni olarak önerilmesi. 22. Ulusal Biyoloji Kongresi

4-) Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Çöl Bekir, 2014. Ekstremofil bir Bacillus izolatınının genomik kütüphanesinden Bor toleransını arttırdığı görülen bir C4 dikarboksilat ABC taşıyıcı proteininin belirlenmesi. 22. Ulusal Biyoloji Kongresi

5-) Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Kapusuz Gülşah, Çöl Bekir, 2013. Bir Pseudomonas izolatından bir sodyum antiport geninin rasgele klonlanması ve Escherichia coli’de Bor toleransında olası etkisi. XIII. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi

6-) Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Kasap Murat, Çöl Bekir, 2013. Ekstremofil bir Staphylococcus izolatının genomik kütüphanesinin oluşturulması ve Bor toleransı ile ilgili genlerin araştırılması. XIII. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi

7-) Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, Güneş Hatice, Arslantürk Ahmet, 2012. Yüksek Bor toleransına sahip bir Staphylocccus aureus suşunun izolasyonu ve filogenetik analizi. 7. Ulusal Moleküler Ve Tanısal Mikrobiyoloji Kongresi

8-) Karakaya Ramazan, Dibek Esra, Akgüç Çöl Nihan, Çöl Bekir, 2012. Bakterilerde hücresel Bor miktarının belirlenmesi için Azomethin H yönteminin kullanılması. 21. Ulusal Biyoloji Kongresi

1-) NMR metabolomics analysis of Escherichia coli cells treated with Turkish propolis water extract reveals nucleic acid metabolism as the major target - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 1

2-) Analysis of the fluid biochemistry in patients with prolonged wound drainage after hip hemiarthroplasty - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1

3-) Genomic library construction of a boron tolerant bacterium in Escherichia coli and selection by boron - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1

4-) Bor içeren bazı biyoaktif bileşikler - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1

1-) Analysis of the fluid biochemistry in patients with prolonged wound drainage after hip hemiarthroplasty - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1

1-) Bor içeren bazı biyoaktif bileşikler - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: Diğer(Uluslararası). Propolise yanıtta rol oynayan E.coli genlerinin KEIO gen nakavt koleksiyonunun taranması ile belirlenmesi ve propolis ve aktif bileşenlerinin etki mekanizmalarının NMR metabolomik yöntemler ile araştırılması. 2019-2021

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1001. Genomik, Proteomik, Metabolomik ve Moleküler yaklaşımlarla Bacillus subtilis'te Bor ile ilgili genlerin ve biyomoleküllerin araştırılması. 2024--1

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Fonksiyonel Genomik Yaklaşımıyla Kastamonu Sarımsak Özsuyunun Antibakteriyel Etkisine Karşı Tolerans Sağlayan Genlerin Escherichia coli’de Araştırılması. 2022--1

2-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Amanita virosa ve Trichaptum biforme ekstraktlarının antikanser ve antibakteriyel etkilerinin araştırılması. 2022--1

3-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1001. Bazı fenolik asitlerin Escherichia coli üzerindeki etkilerinin genom, çözünür proteom ve metabolom düzeyinde moleküler ve biyokimyasal yaklaşımlar kullanılarak araştırılması. 2022--1

4-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1001. Bor Içeren Antibiyotik Epetraborole ve Borik Asitin Bakteri Üzerine Etkisinin ASKA Klonlarının Fonksiyonel Genomik Analizi, 2 Boyutlu Jel Elektroforez Ve Transkriptomik Yaklaşımlarıyla Araştırılması. 2019--1

5-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1001. KEIO mutant koleksiyonu, moleküler, genomik ve proteomik yaklaşımlarla Bor genlerinin araştırılması . 2015-2018

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1002. Escherichia coli üzerinde Bor içeren Antibiyotik Epetraborole'nin Etkisinin Nano LC-MS/MS tabanlı Proteomik ve NMR tabanlı Metabolomik yaklaşımlarıyla araştırılması. 2023--1

2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1002. Bor Toleransı Yüksek Bakteri Izolatlarının Genomik Kütüphanelerinin Oluşturulması Ve Bor Ile Ilgili Genlerin Araştırılması. 2012-2013

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: Farklı coğrafik bölgelerden toplanan farklı renklerde propolis örneklerinin antikanser antioksidan ve apoptoz aktivitelerinin araştırılması. Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Farklı coğrafik bölgelerden toplanan farklı renklerde propolis örneklerinin antikanser antioksidan ve apoptoz aktivitelerinin araştırılması. 2022-2023

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Varroa destructor mücadelesinde kullanılan Flumetrinin fenotipik ve genotipik direncinin araştırılması. 2022--1

2-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Escherichia coli'de yfeS mutantını bor toleransı açısından komplemente eden genlerin belirlenmesi ve fenotipik biyokimyasal testlerle yfeS geninin rolünün araştırılması. 2022--1

3-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Escherichia coli’de Aşırı İfade Edilen Genlerin Bor Toleransına Etkisinin Araştırılması ve Bora Bağlı Gen Ekspresyon Analizleri. 2018-2021

4-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Yüksek Bor Toleransına Sahip Pseudomonas Cinsine Ait Bazı İzolatların Genomik Kütüphanelerinin Oluşturulması ve Bor ile İlgili Genlerin Bulunması. 2012-2013

1-) Kurum Adı: . Birincilik Ödülü. 2013