Personel

Doktor Öğretim Üyesi ERDEM TÜRK
Doktor Öğretim Üyesi
Erdem Türk
@ E-posta
erdemturk@mu.edu.tr
Telefon
0252 211 1638 , 0252 211 5056

Kadro Bilgileri

Görev Birimi

Mühendislik Fakültesi / Bilgisayar Mühendisliği Bölümü / Bilgisayar Yazılımı Abd

Kadro Birimi

Mühendislik Fakültesi / Bilgisayar Mühendisliği Bölümü / Bilgisayar Yazılımı Abd

Öğrenim Bilgileri

Lisans

Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Bilgisayar Mühendisliği 23.06.2014

Yüksek Lisans

Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bilişim Sistemleri Mühendisliği Anabilim Dalı 28.03.2019

Doktora

Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoinformatik Anabilim Dalı 08.02.2024

Yayin Bilgileri

(A-1) SCIE veya SSCI kapsamındaki dergide yayımlanmış makale

1-) Ibrahim Ahmad Hassan, Karabulut Onur Can, Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2023. A correlation coefficient-based feature selection approach for virus-host protein-protein interaction prediction. PLOS ONE
2-) Türk Erdem, Yüksek Ayhan, Ayaz Akif, Süzek Barış Ethem, 2023. DEVOUR: Deleterious Variants on Uncovered Regions in Whole-Exome Sequencing. PEERJ
3-) Karabulut Onur Can, Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Ibrahım Ahmad Hassan, Süzek Barış Ethem, 2021. ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor. Frontiers in Molecular Biosciences

(A-4) ESCI, Scopus veya SPORT Discus kapsamındaki dergide yayımlanmış makale

1-) Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2019. Taxonomic diversity-based domain interaction prediction. Pamukkale University Journal of Engineering Sciences

(A-7) TR Dizin kapsamındaki dergide yayımlanmış makale

1-) Özkaraca Osman, Acar Ethem, Peker Musa, Türk Erdem, 2018. ACİL SERVİSLER İÇİN BULANIK MANTIK TABANLI BİR KLİNİK KARAR DESTEK SİSTEMİ. Mühendislik Bilimleri ve Tasarım Dergisi

(B-3) Uluslararası bilimsel/sanatsal toplantıda sözlü/poster şeklinde sunulan ve özet metni basılı/elektronik olarak yayımlanmış çalışma

1-) Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Karabulut Onur Can, Ibrahim Ahmad Hassan, Süzek Barış Ethem, 2022. A Coronavirus Infection and Host-Shift Predictor. The 30th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
2-) Küçükyılmaz Cansel Hatice, Ibrahim Ahmed Hassan, Aksoy Selahattin, Karabulut Onur Can, Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2022. VIRBIOHUB: A Central Resource for Virus Bioinformatics Research. HIBIT2022-15th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics
3-) Ibrahım Ahmad Hassan, Türk Erdem, Karpuzcu Betül Asiye, Aksoy Selahattin, Karabulut Onur Can, Süzek Barış Ethem, 2021. Assessment of a Novel Feature Selection Algorithm for Virus-Host Protein-Protein Interaction. Intelligent Systems for Molecular Biology - European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 2021)
4-) Arıt Türkan, Türk Erdem, Susuz Delikanlı Mertcan, Uçar İlayda, Süzek Barış Ethem, 2018. A Platform for Comparing Protein Sets and Their Functional Annotations. HIBIT18 - 11th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT)
5-) Türk Erdem, Arıt Türkan, Susuz Delikanlı Mertcan, Uçar İlayda, Süzek Barış Ethem, 2018. ProSetComp: A Platform for Protein Set Comparisons. Proceedings of the 2018 ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics - BCB ’xx18
6-) Türk Erdem, Arıt Türkan, Susuz Delikanlı Mertcan, Uçar İlayda, Süzek Barış Ethem, 2018. A Bioinformatics Platform for Creation and Functional Analysis of Protein Sets. International Conference of Genomics and Bioinformatics (ICGB)
7-) Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2017. Leveraging Taxonomic Ranks for Improving MirrorTree-based Protein Interaction Prediction. HIBIT2017 - 10th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT)
8-) Türk, E., Süzek, B., 2016. Assessing Impact of Taxonomic Diversity and Sequence Conservation-based Filters on Mirrortree Method. Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) 2016
9-) Türk, E., Süzek, B., Çöl, B., 2015. Detecting Boron Related Transmembrane Proteins in Bacillus Boroniphilus. HIBIT2015 - 9th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics

(B-4) Ulusal bilimsel/sanatsal toplantıda sözlü/poster olarak sunulan ve tam metni basılı/elektronik olarak yayımlanmış çalışma

1-) Türk, E., Başar, M.E., Mutlu, O., Karaarslan, E., 2014. Üniversite için Android Tabanlı Mobil Uygulaması ve Geliştirme Sürecinde Öğrenilenler. Akademik Bilişim

(B-5) Ulusal bilimsel/sanatsal toplantıda sözlü/poster olarak sunulan ve özet metni basılı/elektronik olarak yayımlanmış çalışma

1-) Süzek Barış Ethem, Ayaz Akif, Abak Masud Başak, Darwısh Sinem, Türk Erdem, 2023. Klinikte Yeni Nesil Dizilemenin Kullanımını Destekleyen Biyoinformatik Yaklaşımları. 18. Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi
2-) Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2023. Evrimsel Korunma ile Çelişen İnsanda Hastalıkla İlişkili Varyantların Tespit Edilmesi. 25. Ulusal Biyoloji Kongresi
3-) Uslular Göksu, Türk Erdem, Özaydın Sinan, Pembeci İzzet, 2017. Magmatik Kayaç Jeokimyası Verilerinin Yorumlanması Için Yeni Bir Web Tabanlı Uygulama: Öncel Modeller. 70. Türkiye Jeoloji Kurultayı

(C-5) Diğer uluslararası yayınevleri tarafından yayımlanmış bilimsel kitapta bölüm

1-) Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Ibrahim Ahmad Hassan, Karabulut Onur Can, Süzek Barış Ethem, 2023. Protein-Protein Interactions Methods and Protocols/Machine Learning Methods for Virus–Host Protein–Protein Interaction Prediction. Yayın Evi: Springer Science+Business Media/Humana Editör Adı: Mukhtar, Shahid

(E-1) SCIE veya SSCI tarafından taranan ve %10’luk dilimde yer alan dergide yapılan atıf

1-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 4
2-) Taxonomic diversity-based domain interaction prediction - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1
3-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
4-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 3
5-) Taxonomic diversity-based domain interaction prediction - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
6-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1

(E-5) Diğer uluslararası hakemli dergide yapılan atıf

1-) ACİL SERVİSLER İÇİN BULANIK MANTIK TABANLI BİR KLİNİK KARAR DESTEK SİSTEMİ - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 2

(G-4) TÜBİTAK, TÜBA, KOSGEB, (1002 ve 3001 hariç tüm projeler)SBB, Bakanlıklar vb. kamu kurumları veya özel kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan projede görev (araştırmacı, eğitmen, danışman vb. olarak)

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1004. Hedefe Özgü Pan-Kanser Terapiler (PAN-TER): Akut Lenfoblastik Lösemide CAR-T Hücre Tedavilerine Yönelik Yeni Nesil Dizileme Temelli Genetik Analiz Kiti Geliştirilmesi. 2021-2026

(G-9) TÜBİTAK, TÜBA, KOSGEB SBB, Bakanlıklar vb. kamu kurumları veya özel kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan projede G.7 ve G.8 kapsamı dışında görev almak

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1002. İnsan Tüm Ekzom Dizileme Tekniklerinin Kapsamadığı Klinik Önemi Olan Varyantları Tespit Eden ve Anlamlandıran Sistem. 2021-2022
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 3501. Adenoviruslerde konak-özgüllüğü ve türler arası olası geçiş olaylarının tahmini için bir biyoenformatik sistemi geliştirilmesi. 2020-2023

(I-5) Uluslararası sempozyum, kongre, çalıştay, festival, bilimsel yaz okulu, bienal, trienal gibi bilimsel, sanatsal ve tasarıma yönelik etkinliklerde görev almak; uluslararası spor organizasyonlarında hakemlik, antrenörlük, idarecilik yapmak.

1-) HIBIT2015 - 9th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. Turkey. . 2015

(L-10) Dekanlık/Müdürlük tarafından oluşturulan kurul ve komisyonlarda görev almak (her yıl için)

1-) Mühendislik Fakültesi Kalite Komisyonu Üyeliği. Türkiye. . 2024

(L-12) Bölüm Başkanlığı/Disiplinler arası ABD/ASD Başkanlığı, Dekan Yardımcılığı, Yüksekokul/Enstitü Müdür Yardımcılığı yapmak (her yıl için)

1-) Mühendislik Fakültesi Dekan Yardımcılığı. Türkiye. . 2024

(L-13) Bölüm Başkan Yardımcılığı ve Anabilim/Anasanat Dalı Başkanlığı yapmak (her yıl için)

1-) Bilgisayar Mühendisliği Bölüm Başkan Yardımcılığı. Türkiye. . 2024

(L-9) Rektörlük tarafından kurum içi/kurum dışı oluşturulan kurul ve komisyonlarda görev almak (her yıl için)

1-) Yapay Zeka Üst Komisyonu ve Çalışma Grubu. Türkiye. . 2024
2-) Engelli Öğrenci Birimi Koordinatörlüğü Yönetim Kurulu Üyesi. Türkiye. . 2024
3-) Engelli Öğrenci Birimi Koordinatörlüğü Yönetim Kurulu Üyesi. Türkiye. . 2023
4-) Engelli Öğrenci Birimi Koordinatörlüğü Yönetim Kurulu Üyesi. Türkiye. . 2022
5-) Engelli Öğrenci Birimi Koordinatörlüğü Yönetim Kurulu Üyesi. Türkiye. . 2021
6-) Engelli Öğrenci Birimi Koordinatörlüğü Yönetim Kurulu Üyesi. Türkiye. . 2020

Verdiği Dersler

CENG 1009 2024-2025 Güz

Programming Fundamentals

CENG 2001 2024-2025 Güz

Data Structures and Algorithms

CENG 4011 2024-2025 Güz

Senior Design Project I

CENG 1004 2023-2024 Bahar

Introduction to Object Oriented Programming