1-) Ekinci Bora, Edgunlu Tubagokdogan, Bayramoğlu Gülçin, Atay Gulsenulucam, 2018. Molecular investigation of staphylococcal cassette chromosome mec types and genotypic relations of methicillin-resistant staphylococci isolated from before and after hospital exposed students. Indian Journal of Medical Microbiology

2-) Irmak Zöhre, Ekinci Bora, Akgül Ayşe Ferhan, 2010. Hepatitis B and C seropositivity among nursing students at a Turkish university. International Nursing Review

3-) Çoban Ahmet Yılmaz, Birinci Asuman, Ekinci Bora, Durupınar Belma, 2004. Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis by the broth microdilution method with 7H9 broth. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz

4-) Çoban Ahmet Yılmaz, Birinci Asuman, Ekinci Bora, Durupınar Belma, 2004. Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis with nitrate reductase assay. International Journal of Antimicrobial Agents

5-) Çoban Ahmet Yılmaz, Ekinci Bora, Durupınar Belma, 2004. A Multidrug Efflux Pump Inhibitor Reduces Fluoroquinolone Resistance in Pseudomonas aeruginosa Isolates. Chemotherapy

6-) Ekinci Bora, Çoban Ahmet Yılmaz, Birinci Asuman, Durupınar Belma, Ertürk Murat, 2002. In vitro effects of cefotaxime and ceftriaxone on Salmonella typhi within human monocyte-derived macrophages. Clinical Microbiology and Infection

1-) Ekinci Bora, Karacaoğlan Elnur, Bulucu Ebru, Sül Nigar, 2011. Muğla İli Merkez İlköğretim Okulu öğrencilerinde bağırsak parazitleri araştırılması. Turkish Journal of Parasitology

1-) Ekinci Bora, Durupınar Belma, Ertürk Murat, 2016. Relation between Early Life Human Herpes Simplex Virus – I Infection and Food Allergy: An Animal Model in Balb/C Mice. International Journal of Health Sciences

2-) Ekinci Bora, Goktas Atila, 2013. Awareness and knowledge levels about HIV/AIDSamong high school students in Mugla, Turkey. Journal of AIDS and HIV Research

1-) Yapıcı Oktay, Yapıcı Hafize, Saygılı Pekintürk Nilüfer, Akgüneş Alper, Akgül Senem, Ekinci Bora, 2019. Karbapenemaz üreten enterobacteriaceae izolatlarının immünokromatografik kart test RESIST-3 O.K.N. K-SET ile değerlendirilmesi. Ege Tıp Dergisi

2-) Yapıcı Oktay, Akgunes Alper, Akgül Senem, Ekinci Bora, Saygılı Pekintürk Nilüfer, 2018. Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Direnç Durumunun Yıllar İçindeki Değişimi. Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi Tıp Dergisi

1-) Şen Huriye, Ekinci Bora, Kıvrak Şeyda, 2019. SUMAK BİTKİSİNİN FONKSİYONEL VE BİYOLOJİK AKTİVİTESİ. GANUD INTERNATIONALCONFERENCE ON GASTRONOMY,NUTRITION AND DIETETICS

2-) Alataş Duygu, Ekinci Bora, 2019. KISA ZİNCİRLİ YAĞ ASİTLERİ: BESİN KAYNAKLARI VE MİKROBİYOTA BAĞLANTISI. GANUD INTERNATIONALCONFERENCE ON GASTRONOMY,NUTRITION AND DIETETICS

3-) Şen Huriye, Kıvrak İbrahim, Ekinci Bora, 2019. Lavantanın Biyoaktif Özellikleri ve Potansiyel Uygulamaları (Bioactive Properties and Potential Applications of Lavender). Ganud International Conference on Gastronomy, Nutrition and Dietetics

4-) Türkyılmaz Ayşegül, Ekinci Bora, 2018. Evaluation of Allergic Properties of GMO Foods. 1st International Health Science and Life Congress

1-) Aslan Özlem, Ekinci Bora, Sönmezdağ Ahmet Salih, 2023. Fermentation of bergamot (Citrus bergamia) fruit with Lactobacillus plantarum: Phenolic compounds, antioxidant activity, and prebiotic properties.. 3rd International Conference on RAW MATERIALS TO PROCESSED FOODS

1-) Yelken Birgül, Us Tercan, Bayram Banu, Erkasap Nilüfer, Ekinci Bora, Ekemen Serdar, 2014. Determination of SCCMec types and RAPD-PCR fıngerprinting of methicillin resistant Staphylococcus aureus isolated from intensive care unit patients. ESICM LIVE 2014 (European Society for Intensıve Medicine)

2-) Ekinci Bora, Edgunlu Tubagokdogan, Bayramoğlu Gülçin, Ulucam Atay Gülsen, Kuru Oktay, 2013. Characterization of methicillin resistant Staphylococci isolated from students completely not connected to hospital environment. 8th Balkan Congress of Microbiology, Microbiologia Balkanica

3-) Ekinci Bora, 2008. Survey of Staphylococcal carriage at nursing students before and after hospital training. Meetings of the Three Divisions of the International Union of Microbiological Societies 2008 “XII. International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology”

1-) Ekinci Bora, Pıçakçıefe Metin, Yıldırım Döndü, 2009. Tekrarlayan Bir Enterobius vermicularis olgusu. 16.Ulusal Parazitoloji Kongresi

1-) Ekinci Bora, 2021. Fonksiyel Besinlerin Sağlıktaki Rolü/Probiyotik ve Prebiyotikler. Yayın Evi: Güven Plus Grup A.Ş. Editör Adı: Müge ARSLAN

2-) Ekinci Bora, 2021. Sürdürülebilir Beslenme/Gastrointestinal Sistemde Disbiyozisten Mikrobiyotaya. Yayın Evi: Ortadoğu Reklam Tanıtım Yayıncılık Turizm Eğitim İnşaat Sanayi ve Ticaret A.Ş Editör Adı: Erşan KARABABA

3-) Ekinci Bora, 2021. Gıda Mikrobiyolojisi/Sindirim Sistemi Mikrobiyotasının İnsan Sağlığı, Beslenme ve Metabolizma Üzerine Etkileri. Yayın Evi: Efil Yayınevi, Eflatun Basım Dağıtım Yayım ve Matbaacılık Hizm. A.Ş., Kozan ANKARA Editör Adı: ERKMEN OSMAN

1-) Ekinci Bora, Durupınar Belma, 2012. Küçük Deney Hayvanlarından Rat/Ratlarda Mikrobiyolojik Deneysel Çalışmalar. Yayın Evi: Journal of Clinical and Analytical Medicine Kitap Serisi Editör Adı: Yücel O.

1-) Ekinci Bora, 2014. Klinik Mikrobiyoloji Yöntemleri El Kitabı/A Grubu Streptekok Enfeksiyonlarının Serolojik Tanısı. Yayın Evi: Atlas Kitabevi (American Society for Microbiology Press) Editör Adı: Başustaoğlu A., Yıldıran Ş.T.

2-) Ekinci Bora, Durupınar Belma, 2010. Modern Cerrahi Pratiğin Biyolojik Temeli (Sabiston Textbook of Surgery)/İnflamatuar yanıtın medyatörleri olarak sitokinlerin rolü. Yayın Evi: Nobel Tıp Kitabevi Editör Adı: Ulusoy, A.N, Topgül K.

1-) International Nursing Review. 2023. Hakemlik Sayısı: 1

2-) International Nursing Review. 2021. Hakemlik Sayısı: 1

1-) International Blood Research & Reviews. 2024. Hakemlik Sayısı: 1

2-) Asian Journal of Biochemistry, Genetics and Molecular Biology . 2023. Hakemlik Sayısı: 1

3-) International Journal of TROPICAL DISEASE & Health. 2023. Hakemlik Sayısı: 1

4-) Journal of Pharmaceutical Research International. 2022. Hakemlik Sayısı: 1

5-) Microbiology Research Journal International . 2022. Hakemlik Sayısı: 1

6-) International Journal of TROPICAL DISEASE & Health . 2022. Hakemlik Sayısı: 1

7-) International Blood Research & Reviews . 2022. Hakemlik Sayısı: 1

8-) International Journal of TROPICAL DISEASE & Health . 2021. Hakemlik Sayısı: 1

9-) International Journal of Research and Reports in Hematology . 2020. Hakemlik Sayısı: 1

10-) International Journal of Research and Reports in Hematology . 2020. Hakemlik Sayısı: 1

11-) Journal of Advances in Medicine and Medical Research . 2020. Hakemlik Sayısı: 1

12-) Journal of Scientific Research and Reports. 2020. Hakemlik Sayısı: 1

1-) Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis by the broth microdilution method with 7H9 broth - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 1

2-) Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis with nitrate reductase assay - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 1

3-) Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis with nitrate reductase assay - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 1

4-) Hepatitis B and C seropositivity among nursing students at a Turkish university - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 2

5-) A Multidrug Efflux Pump Inhibitor Reduces Fluoroquinolone Resistance in Pseudomonas aeruginosa Isolates - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1

6-) Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis by the broth microdilution method with 7H9 broth - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1

7-) Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis by the broth microdilution method with 7H9 broth - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 2

8-) Hepatitis B and C seropositivity among nursing students at a Turkish university - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1

9-) A Multidrug Efflux Pump Inhibitor Reduces Fluoroquinolone Resistance in Pseudomonas aeruginosa Isolates - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1

10-) Hepatitis B and C seropositivity among nursing students at a Turkish university - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1

11-) In vitro effects of cefotaxime and ceftriaxone on Salmonella typhi within human monocyte-derived macrophages - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1

12-) Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis by the broth microdilution method with 7H9 broth - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 3

13-) Drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis with nitrate reductase assay - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 1

1-) Molecular investigation of staphylococcal cassette chromosome mec types and genotypic relations of methicillin-resistant staphylococci isolated from before and after hospital exposed students - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1

1-) Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Direnç Durumunun Yıllar İçindeki Değişimi - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1

1-) Tez Adı: BERGAMOT (CİTRUS BERGAMİA) MEYVESİNİN LACTOBACİLLUS PLANTARUM SUŞU İLE FERMANTASYONU: FENOLİK BİLEŞİKLERİN, KISA ZİNCİRLİ YAĞ ASİTLERİNİN ANALİZİ. Konu: Son yıllarda kolon sağlığımızın genel sağlığımız üzerindeki etkileri daha net ortaya kondukça probiyotikler ve prebiyotikler en çok araştırılan ve adından en sık bahsedilen kavramlar haline gelmiştir. Bu kapsamda, biyoaktif bileşikler içeren yeni fermente ürünler de, sağlığı geliştirici işlevleri nedeniyle artan bir ilgi görmektedir. Bu çalışma bergamot meyvesinin, L. plantarum ile fermantasyonu sonucu içeriğinde meydana gelen değişiklikleri incelemek ve bergamot meyvesinin prebiyotik aktivitesini gözlemlemek amacıyla planlanıp yürütülmüştür. Çalışmada bergamot meyvesi albedo kısmıyla birlikte homojen hale getirilmiş, 106 kob/ml L. plantarum suşu eklenerek 30 °C’de 6 gün fermente edilmiştir. L. plantarum eklenmeyen kontrol grubu ile karşılaştırılmıştır. 0., 2., 3., 4. ve 6. günlerde alınan örneklerde canlı hücre sayısı, pH, antioksidan aktivite, toplam fenolik madde içeriği, kısa zincirli yağ asitleri (asetat, bütirat, propiyonat) ve fenolik bileşik (naringin, neohesperidin, neoeriositrin, neoeriositrin-di-oksalat, neohesperidin-di-oksalat) içeriği incelenmiş ve kontrol grubu ile karşılaştırılmıştır. pH değeri kontrol grubunda 5.4’e, L. plantarum suşu eklenen LAB grubunda 3.7’ye düşmüştür. 2,2?-azinobis (3-etilbenzotiyazolin-6-sülfonik asit) (ABTS) yöntemi ile ölçülen antioksidan aktivite, kontrol grubunda 8.56 mM Trolox/l’den 7.63 mM Trolox/l’ye düşerken, LAB grubunda 9.72 mM Trolox/l’ye yükselmiştir. 2,2-Difenil-1-pikrilhidrazil yöntemiyle yapılan ölçümlerde; antioksidan aktivite kontrol grubunda 3.25 mM Trolox/l’den 2.8 mM Trolox/l’ye düşerken, LAB grubunda 3.55 mM Trolox/l’ye yükselmiştir. Kontrol grubunun toplam fenolik madde içeriği 20.17 GAE, mg/l’den 20.78 GAE, mg/l’ye yükselmiştir. LAB grubunun toplam fenolik madde içeriği 20.17 GAE, mg/l’den 21.74 GAE, mg/l’ye yükselmiştir. Antioksidan aktivite ile toplam fenolik madde içeriğinde meydana gelen değişiklikler paralellik göstermiştir. L. plantarum ile fermantasyon sonrası neoeriositrin, naringin, neoeriositrin-di-oksalat ve neohesperidin konsantrasyonları artarken, melitidin ve neohesperidin-di-oksalat konsantrasyonları azalmıştır. Gruplara göre neoeriositrin, neoeriositrin-di-oksalat, neohesperidin ölçüm ortalaması arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark olduğu ve ölçüm ortalamalarının deney grubunda daha yüksek olduğu görülmüştür (p<0.05). Bergamot meyvesinin prebiyotik aktiviteye sahip olduğu ve 6 günlük fermantasyon süresince probiyotik gıda olarak kabul edilebileceği sonucuna varılmıştır. Probiyotiklerin sağlık yararları göz önüne alındığında, bergamot meyvesinin farklı gıdalara işlenme olanaklarının arttırılarak ülke ekonomisine kazandırılması ve daha yaygın tüketilmesinin teşvik edilmesi önerilmektedir.. ÖZLEM-ASLAN BURSALI. 2023

2-) Tez Adı: UŞAK İLİNDE YAŞAYAN YETİŞKİN BİREYLERDE İRRİTABL BAĞIRSAK SENDROMU ALT TİPLERİ VE ŞİDDETİNİN DİYET TETİKLEYİCİLERİYLE İLİŞKİSİ. Konu: İrritabl bağırsak sendromu (İBS) semptomlarını tetikleyen önemli faktörlerden birinin gıdalar olduğu bilinmektedir. Bu sebeple son yıllarda FODMAP diyeti gibi dışlama diyetleri popülerlik kazanmıştır. Çok yönlü etiyolojisi ve farklı klinik tablolar sebebiyle uygulanacak diyetler zor ve karmaşık görünmektedir. Bu çalışma İBS’li bireylerde çeşitli semptomlara neden olan veya var olan semptom şiddetini artırdığı düşünülen ve dışlama diyetlerindeki kısıtlamalarda öne çıkan 38 diyet tetikleyicisinin İBS alt tipleri ve şiddet alt gruplarında farklı semptom şiddetine neden olup olmadığını saptamak amacıyla gerçekleştirilmiştir. Uşak'ta yaşayan 18-65 yaşında İBS’li 300 katılımcının anketi doldurmasıyla veri toplama aşaması tamamlanmıştır. Beyaz ekmek, makarna, portakal, elma, kırmızı et, tavuk, çikolata, tatlı ve kahve tüketiminin konstipasyon baskın İBS (İBS-C) alt tipinde diyare baskın İBS (İBS-D), miks tip İBS (İBS-M) ve sınıflandırılmamış İBS (İBS-U) alt tiplerine göre semptom şiddetini daha fazla artırdığı görülmüştür (p<0.05). Kepekli ekmek, buğday ve lahana tüketiminin İBS-D alt tipinde diğer alt tiplere göre daha şiddetli semptomlara neden olduğu belirlenmiştir (p<0.05). Mantar tüketiminin İBS-C alt tipinde diğer alt tiplere göre semptom şiddetini daha az etkilediği saptanmıştır (p<0.05). Beyaz ekmek, kepekli ekmek, makarna, kahvaltılık gevrekler, baharatlı yiyecekler, portakal, elma, muz, üzüm, sarımsak, biber, domates, yumurta, kırmızı et, yağlı yiyecekler, kızartmalar, cips, çikolata, tatlı, acı biber ve kahve tüketiminin hafif İBS şiddet alt grubunda diğer şiddet alt gruplarına göre semptom şiddetini daha az etkilediği saptanmıştır (p<0.05). Semptom şiddetini farklı etkilediği belirlenen bu gıdaların ilgili alt tip ve şiddet alt gruplarındaki bireylerin diyetlerinde kısıtlanacak gıdaların belirlenmesi aşamasında göz önünde bulundurulması ve İBS alt tip ve şiddet alt gruplarında tetikleyici gıdaların tanımının yapılması önemlidir.. ESRA-YILMAZ. 2023

1-) Tez Adı: PROBİYOTİK BAKTERİLERİN FARKLI SÜT TÜRLERİNDE AFLATOKSİN M1 DETOKSİFİKASYON KAPASİTELERİNİN BELİRLENMESİ. Konu: Beslenme ve Diyetetik Tezli Yüksek Lİsans Programı. Kübra-Şanaldı. 2021

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: Son yıllarda kolon sağlığımızın genel sağlığımız üzerindeki etkileri daha net ortaya kondukça probiyotikler ve prebiyotikler en çok araştırılan ve adından en sık bahsedilen kavramlar haline gelmiştir. Bu kapsamda, biyoaktif bileşikler içeren yeni fermente ürünler de, sağlığı geliştirici işlevleri nedeniyle artan bir ilgi görmektedir ve bu nedenle, meyve sirkelerine de artan bir talep vardır. Diyet lifleri ve dirençli nişastalar gibi prebiyotiklerin kolon mikrobiyotası tarafından sakkarolitik fermantasyonu, başta asetat, propiyonat ve bütirat olmak üzere kısa zincirli yağ asitleri, ısı ve gaz oluşumuna yol açmaktadır. Fruktooligosakkaritler, inülin, galaktooligosakkaritler, özellikle ß-glukan ve pektin içeren turunçgiller ve keçiboynuzu gibi besinler yüksek oranda kısa zincirli yağ asidi (KZYA) üretim kaynaklarıdırlar. KZYA moleküllerinin antiinflamatuar olmanın yanında, bağışıklığı düzenleme, kanser hücrelerinin apoptozisini uyarma, bireyde tokluk hissi oluşturan hormonları ve hipotalamusu etkileyerek obeziteden koruma, serum kolesterol ve glikoz seviyelerini düzenleme gibi sağlığımıza faydalı birçok etkisi bulunmaktadır. Türkiye'de yetiştiği yerler Antalya, Adana, Mersin ve Hatay başta olmak olmak üzere Doğu Akdeniz'in kıyı kesimleri olan bergamot, bileşimi ve yüksek flavonoid içeriği (neoeriositrin, neohesperidin, naringin, rutin, neodesmin, rhoifolin ve poncirin gibi) nedeniyle diğer turunçgil meyvelerinden farklıdır ve bergamot suyu ile albedosunda prebiyotik olarak kabul edilen pektin bulunmaktadır. Bergamot neredeyse yalnızca kabuğundan çıkarılan uçucu yağlar üretmek için yetiştirilmektedir. Ancak bu amaçla işlenmesi önemli miktarda israfa neden olurken, atık haline gelen meyve suyu, kabuk, albedo gibi kısımları statin benzeri özellikler gösteren antikolesterolemik bileşik brutieridin ve melitidin gibi sağlığa yararlı bileşikleri yüksek miktarda içerirler. Üstelik yıllık olarak, işleme endüstrilerinde biriken narenciye atığının dünya çapında 60 milyon tonun üzerinde olduğu tahmin edilmektedir. Bergamot meyvesinde en bol bulunan flavonoidler naringin, neohesperidin, neoeriositrindir ve meyvenin suyunun acı tadından sorumlu flavanone-7-oneohesperidoside yapısına sahiptirler. Antikanser, antioksidan, antibakteriyel, antifungal gibi farmakolojik özellikleri ile alkolik olmayan yağlı karaciğer ve kardiyovasküler hastalıklar, tip-2 DM ve metabolik sendromlar dahil kronik enflamatuar hastalıklar üzerine faydalı etkileri bulunmaktadır. Çalışmamızda ticari olarak satın alınan taze bergamot meyvesi aseptik koşullara dikkat edilerek albedosu ile birlikte parçalanacak, homojen hale getirilecek, sodyum karbonat gibi bazik karakterli bileşikler ile pH ayarlaması yapılacak ve 106 kob/ml L. plantarum suşu eklenerek fermentasyona bırakılacaktır. Ayrıca L. plantarum suşu eklenmeyen bir örnek de doğal içeriğinin değişiminin izlenmesi amacıyla kontrol grubu olarak kullanılacaktır. Fermantasyon sonucu elde edilen ve kontrol grubundaki üründen belirli günlerde örnek alınacak ve analiz edilecektir. Çalışmamızın sonucunda bergamot meyvesinin prebiyotik aktivitesini, toplam fenolik madde miktarını, naringin, neoeriositrin ve neohesperidin flavonoidleri ile kısa zincirli yağ asitlerinin (bütirat, propiyonat, asetat) miktarını ve antioksidan aktivitesini tespit etmeyi amaçlıyoruz. Bu çalışma bergamot meyvesinin bazı bileşenleri ve sağlık üzerine etkileriyle ilgili literatüre yeni bilgiler kazandırmayı, farklı gıdalara işlenme olanaklarının arttırılarak ülke ekonomisine kazandırılmasını ve daha yaygın tüketilmesini sağlamayı, sağlıklı besin tüketimini teşvik etmeyi amaçlamaktadır.. Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Bergamot (Citrus bergamia) meyvesinin Lactobacillus plantarum suşu ile fermantasyonu: Fenolik bileşiklerin, kısa zincirli yağ asitlerinin analizi. 2021-2023

2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: Bakterilere karşı tedavide kullanılan antibiyotiklere direnç eradikasyonda karşılaşılan en büyük problemdir. Dirence neden olan genotipik veya fenotipik kazanımlar bakteriler arası aktarılabildiği gibi mutasyon yolu ile de oluşabilmektedir. Bunun en büyük sebebi antibiyotik kullanım kurallarına uyulmamasıdır. Bir bakteriyi MDR olarak sınıflandırmanın kuralı 5 antibiyotik grubundan en az 2 ve daha fazla gruba karşı direnç gözlenmesidir. Eğer antibiyotik duyarlılık testlerinde kullanılan bütün ilk seviye antibiyotiklere direnç gözlenirse o zaman “herşeye dirençli” anlamında pan-drug resistant (PDR) olarak sınıflandırılmaktadır (1). A.baumanni türlerinde ise son yıllarda MDR ve PDR tipinde direnç gözlenmektedir. Antibiyotik direncinin yanında A.baumanni hastane ortamında uzun süre eradike edilemeden bulunabilir ve yaygın hastane infeksiyonlarına sebep olabilir. Dolayısıyla MDR A.baumannii neden olduğu infeksiyonlar tedavisi en zor infeksiyonlar arasındadır. A.baumannii, beta-laktamaz enzim üretimi, dış membran proteinlerinde değişim, penisilin bağlayan protein ekspresyonu, artmış aktivitede efluks pompası varlığı gibi birçok beta laktam antibiyotiklere dirence sebep olan moleküler mekanizmalara sahiptir. Fakat sefalosporinlere ve karbapeneme dirence sebep olan en sık görülen mekanizma beta-laktam grubu antibiyotiklerin beta-laktamaz enzimi ile yıkımıdır (2,3). Disk diffuzyon yöntemi ile yapılan duyarlılık testlerinde her ne kadar dirençli olarak tespit edilse de, özellikle karbapenem ve kolistin direncinin MİK testi ile doğrulanması gerekmektedir. A.baumannii’de karbapenem direnci birden fazla mekanizmayla ortaya çıkabilse de direnç en sık beta-laktamaz enzimleri yoluyla gerçekleşmektedir. Bu enzimler D grubu beta- laktamaz sınıfına ait dört OXA alt kümesinde ifade edilmektedir. Bu kümeleri temsilen de genellikle doğal olarak bulunan OXA-51 ve kazanılmış OXA-23, OXA-24 ve OXA-58 öne çıkmaktadır (1,4). İzolatların hepsi MDR olarak saptanan izolatlardır. Muğla bölgesinde görülme sıklığından ziyade hangi beta-laktamaz tipinde direnç genlerine sahip olduğunu göstermek amacı ile önemli veriler sağlayacaktır. Bu kapsamda beta-laktam grubu antibiyotiklere dirençli olarak saptanmış MDR A.baumannii izolatlarında beta-laktamaz gen varlığı ve genotipleme yapılması planlanmaktadır. Ambler sınıflaması D sınıfı beta-laktamazları kodlayan gen bölgelerinin aktif olmasını sağlayan insersıyon elementi (IS) varlığı da beta-laktamazların aktivasyonunda önemli yer teşkil etmektedir. PCR ile standart primer setleri ile tespit edilemeyen fakat fenotipik olarak karbapenem grubu antibiyotiklere direnç gözlenen izolatlarda IS elementi varlığı sık karşılaşılan durumdur. Böyle izolatlarda IS elenti ISAba I varlığının da araştırılması gerekmektedir (5,6,7). IS elementi ile birlikte bakıldığında tespit edilemeyen betalaktamaz enzim tipleri de gösterilmiş olacak ve sınıflamaları belirlenmiş olacaktır. Türkiye’de birçok bölgede Beta laktamaz Ambler sınıflamasına göre karbapenemaz direncinin genotipleri ile ilgili çalışmalar ve bulgular var olmasına rağmen, özellikle turizm bölgesi olması nedeni ile birçok ülkeden gelen popülasyonu ağırlayan Muğla ilinde Beta laktamazların prevelansı, görülme sıklığı ile ilgili çalışma yoktur (8). Bu sebeple Muğla S.K.Ü. E.A. hastanesinden elde edilen A.baumanni izolatları değerlendirilmiş ve 65 adet çoklu ilaca dirençli izolat tespit edilerek çalışma kapsamına alınmıştır. Bu izolatlara ek olarak A.baumanni ATCC 19606 suşu da kontrol olarak çalışmaya dahil edilmiştir. Bu izolatlarda sınıf A, B ve D grubu beta laktamaz varlığı 8 farklı primer kullanılarak IS elementi ile birlikte polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile araştırılacaktır. Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Çoklu ilaca dirençli Acinetobacter baumannii klinik izolatlarında Beta-laktamaz genlerinin tespiti ve tiplendirilmesi. 2019-2021

1-) Bölüm Başkanlığı. . . 2021

1-) Bölüm Başkan Yardımcılığı. . . 2023